修改增值税发票的备注有可能构成犯罪，并可能导致判刑。具体分析如下：

1. 法律规定：根据《中华人民共和国发票管理办法》及其实施细则，发票的开具应当符合规定的时限、顺序、栏目，并全部联次一次性如实开具，任何单位和个人不得有下列虚开发票的行为，包括为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，以及让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票等。备注栏作为发票的重要组成部分，其内容的真实性、准确性同样受到法律的严格保护。

2. 修改备注的法律后果：如果修改增值税发票的备注，使得发票内容与实际经营业务情况不符，或者违反了其他相关税收法规，就可能构成虚开发票的行为。根据情节的严重性，这种行为可能触犯《中华人民共和国刑法》中关于虚开增值税专用发票、用于骗取出口退税、抵扣税款发票罪的规定，从而面临刑事处罚，包括判刑。

3. 特殊情况：当然，也存在一些特殊情况，比如因笔误或系统原因导致的轻微错误，且及时更正并未造成税收损失的，可能不会被视为犯罪行为。但这需要具体情况具体分析，并由税务机关或司法机关根据相关法律法规进行判断。

综上所述，修改增值税发票的备注是一个严肃的法律问题，有可能构成犯罪并导致判刑。因此，建议在实际操作中严格遵守相关法律法规，确保发票的开具真实、准确、合法。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。