将49条烟放在车里是否违法，主要取决于运输目的、方式以及是否遵守相关法律法规。以下是对此问题的详细分析：
一、不违法的情况
个人自用且数量在限额内：
- 根据相关规定，个人乘坐车、船、飞机等交通工具，跨地（市）携带卷烟的最高限量为每人次1万支（即50条）。因此，在不超过这一限量，并且确系个人正常自用、合理数量的情况下，将49条烟放在车里是合法的。
- 例子：如果您是从一个城市到另一个城市自驾游，携带了49条烟用于自己和家人的消费，且没有进行销售等商业活动，那么这种行为是合法的。
人货不分且数量合规：
- 若运输过程中人货未分离，即视为个人携带，同样遵循上述限量规定。49条烟不超限额，因此不违法。
二、违法的情况
用于商业经营：
- 如果运输目的不是个人自用，而是用于销售等商业经营活动，且在没有取得相应烟草专卖许可证的情况下，即使数量未达50条，也属于违法行为。烟草作为专卖品，未经许可从事相关经营行为将违反《烟草专卖法》。
- 例子：如果您将49条烟放在车里，意图在另一个城市进行销售，且没有办理烟草专卖许可证，那么这种行为就是违法的。
人货分离且超量：
- 若采用邮寄、托运等方式进行运输，且人货分离，则必须严格遵守限量规定。具体来说，邮寄、托运卷烟每件以2条为限，超过此限制即属违法。同时，每人每次限寄一件，不得多件或多次交寄。虽然49条烟在个人携带方面不超量，但如果通过邮寄或托运方式且未按规定办理，则可能违法。不过，就您的情况而言，如果是放在车里自运，这一点主要适用于邮寄或托运场景，但可作为理解法规的参考。
逃避监管：
- 即使在数量上未超标，但如果运输行为存在逃避监管、故意隐匿等不正常情况，也可能被认定为违法。
- 例子：如果您将49条烟藏在车的隐蔽部位，意图逃避检查，那么这种行为可能被视为违法。
三、违法运输的处罚
对于无准运证或者超过准运证规定的数量托运或者自运烟草专卖品的，根据《中华人民共和国烟草专卖法实施条例》第五十二条，将处以违法运输的烟草专卖品价值百分之二十以上百分之五十以下的罚款，并可以按照国家规定的价格收购违法运输的烟草专卖品。在某些严重情况下，如非法运输的烟草专卖品价值超过一定数额、被多次处罚、抗拒检查或非法运输走私烟草专卖品等，将面临更严厉的处罚，包括没收违法运输的烟草专卖品和违法所得，甚至可能承担刑事责任。
四、建议与指导
在运输香烟时，应首先明确运输目的和方式，确保符合相关法律法规的规定。如果是个人自用且数量在限额内，可以选择携带；如果是商业经营需要，则必须依法取得相应的烟草专卖许可证，并严格按照许可范围进行运输和经营。同时，应积极配合相关部门的监管工作，避免任何形式的逃避监管或隐匿行为。
综上所述，将49条烟放在车里是否违法需综合考虑多个因素，包括运输目的、方式以及是否遵守相关法律法规等。在运输前务必了解并遵守相关规定，以免触犯法律。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。