当企业收到两份协助查封冻结通知书时，这通常意味着企业可能涉及到了不同的法律案件或法律程序，且这些案件或程序中的相关方（如法院、监察机关等）认为有必要对企业的某些财产进行查封或冻结，以保障案件的顺利进行或相关权益的实现。针对这一情况，企业可以按照以下步骤进行处理：
一、核实通知书的真实性及内容
- 确认来源：首先，企业需要确认这两份协助查封冻结通知书的来源是否合法、正规，是否来自有权机关（如法院、监察机关等）。
- 核对内容：仔细阅读通知书上的内容，包括查封冻结的财产范围、期限、理由等，确保对每一项内容都有清晰的理解。
二、评估影响及风险
- 财产影响：评估查封冻结对企业正常运营和财务状况的影响，包括但不限于资金链、生产要素、资产价值、信用体系等方面。
- 法律风险：分析企业可能面临的法律风险，如是否涉及违法犯罪、是否可能面临进一步的法律制裁等。
三、采取应对措施
- 咨询专业法律意见：及时咨询专业律师或法律顾问，了解查封冻结的法律后果及应对策略，确保企业的合法权益得到保障。
- 配合执行机关工作：按照通知书上的要求，积极配合执行机关的工作，如提供相关财产证明、协助执行等。
- 申请复议或异议：如果企业认为查封冻结存在错误或不当之处，可以在规定时间内向执行机关提出复议或异议申请，寻求法律救济。
四、加强内部管理
- 完善财务管理：加强企业财务管理，确保财务记录清晰、准确，以便在需要时提供有力的财务证明。
- 规范经营行为：规范企业的经营行为，避免涉及违法犯罪活动，减少因违法行为导致的法律风险。
五、关注后续进展
- 及时了解情况：密切关注查封冻结的后续进展情况，包括是否解除、是否续冻等，以便及时调整应对策略。
- 保持沟通：与执行机关保持密切沟通，及时了解案件进展和执行情况，确保企业的合法权益得到及时、有效的保障。
六、考虑破产或重整等法律程序（如适用）
如果企业因查封冻结等法律程序导致经营困难或资不抵债，可以考虑通过破产或重整等法律程序来化解危机。这需要根据企业的实际情况和法律规定来具体操作。
总之，企业在收到协助查封冻结通知书时，应保持冷静、积极应对，通过咨询专业法律意见、配合执行机关工作、加强内部管理等方式来保障企业的合法权益。同时，也要密切关注后续进展情况，及时调整应对策略。