结论：申请人涉嫌违法正被调查时，能否受理并给予行政许可，需根据具体情况判断，并非一概而论。以下从多个角度进行分析：
一、法律原则与规定
行政许可的受理条件：
- 根据《中华人民共和国行政许可法》的相关规定，行政机关受理行政许可申请，应当审查申请材料是否齐全、是否符合法定形式。若申请材料齐全、符合法定形式，或者申请人按照行政机关的要求提交全部补正申请材料的，行政机关应当受理行政许可申请。
- 然而，该法并未直接规定申请人涉嫌违法正在被调查时，行政机关是否应受理其行政许可申请。这通常需要结合其他法律法规及具体案情来判断。
涉嫌违法对行政许可的影响：
- 如果申请人涉嫌的违法行为与所申请的行政许可事项直接相关，且该违法行为可能影响其申请行政许可的资格或条件（如信用状况、资质要求等），则行政机关在受理时可能会更加谨慎，甚至可能拒绝受理或不予许可。
- 如果涉嫌的违法行为与所申请的行政许可事项无直接关联，或者该违法行为不影响其申请行政许可的资格或条件，则行政机关在审查申请材料齐全且符合法定形式后，仍可能受理并给予行政许可。
二、具体情形分析
违法行为与申请事项直接相关：
- 例子：申请人因涉嫌生产销售假冒伪劣产品被调查，同时申请生产许可证。在此情况下，由于涉嫌的违法行为与申请事项直接相关，且可能影响其生产资质和信用状况，行政机关可能会拒绝受理或不予许可。
- 法律建议：在此类情况下，申请人应积极配合调查，尽快澄清事实，消除不良影响。同时，可咨询专业律师，了解自身权益及可能的法律后果，以便更好地应对行政机关的审查。
违法行为与申请事项无直接关联：
- 例子：申请人因涉嫌交通肇事被调查，同时申请营业执照。在此情况下，由于涉嫌的违法行为与申请事项无直接关联，且不影响其经营资质和信用状况（除非该违法行为导致申请人被吊销营业执照或相关资质），行政机关在审查申请材料齐全且符合法定形式后，仍可能受理并给予行政许可。
- 法律建议：在此类情况下，申请人应如实向行政机关说明情况，提供必要的证明材料，以证明涉嫌的违法行为与申请事项无直接关联。同时，可咨询专业律师，了解自身在申请过程中的权益及注意事项。
三、行政机关的自由裁量权
- 行政机关在受理行政许可申请时，享有一定的自由裁量权。这意味着，在符合法律法规的前提下，行政机关可以根据具体案情和公共利益的需要，决定是否受理并给予行政许可。
- 因此，即使申请人涉嫌违法正在被调查，行政机关也可能根据具体情况，如违法行为的性质、严重程度、与申请事项的关联度等，来决定是否受理其行政许可申请。
总结与建议：申请人涉嫌违法正被调查时，能否受理并给予行政许可，需根据具体情况判断。建议申请人在申请行政许可时，如实向行政机关说明情况，提供必要的证明材料，并咨询专业律师以了解自身权益及可能的法律后果。如有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。