操纵股价案子的立案过程是一个严谨且复杂的法律程序，它涉及多个环节和多个机构的协作。以下是一个详细的立案过程概述：

一、线索发现与初步调查

1. 线索来源：操纵股价的线索可能来源于多个方面，包括市场监管机构的日常监控、投资者的举报、媒体报道以及交易所的异常交易监测等。

2. 初步调查：一旦发现可疑线索，相关监管机构（如中国证券监督管理委员会）会立即启动初步调查程序。这通常包括收集相关交易数据、账户信息、资金流动情况等，以初步判断是否存在操纵股价的行为。

二、正式立案与调查

1. 正式立案：如果初步调查发现存在足够的证据表明可能存在操纵股价的行为，监管机构会正式立案，并成立专门的调查组进行深入调查。

2. 深入调查：调查组会进一步收集证据，包括但不限于交易记录、账户操作记录、资金流水、相关人员的询问笔录等。同时，调查组还可能对涉案人员进行传唤、询问，甚至进行现场检查。

3. 技术分析：在调查过程中，监管机构还会利用先进的技术手段对交易数据进行深入分析，以识别操纵股价的具体手法和模式。例如，通过分析申报与撤单的频率、比例、时间等，来判断是否存在虚假申报等操纵行为。

三、证据收集与认定

1. 证据收集：调查组会全面收集与案件相关的所有证据，确保证据的充分性、完整性和合法性。这包括书面证据、电子证据、证人证言等。

2. 证据认定：在收集到足够证据后，监管机构会对证据进行认真审查和认定。这通常涉及对证据的真实性、关联性、合法性进行评估，以确定其是否能够作为定案的依据。

四、行政处罚或刑事追责

1. 行政处罚：如果操纵股价的行为被认定为违反了《证券法》等相关法律法规，但尚未构成犯罪，监管机构会依法对涉案人员或机构进行行政处罚。这可能包括罚款、没收违法所得、市场禁入等措施。以您提供的中国证券监督管理委员会行政处罚决定书为例，朱泽宇因操纵多只股票被没收违法所得并处以罚款。

2. 刑事追责：如果操纵股价的行为情节严重，构成犯罪，监管机构会将案件移送司法机关进行刑事追责。这通常涉及对涉案人员的刑事立案、侦查、起诉和审判等程序。以您提到的全国首例虚假申报型操纵证券市场案为例，涉案人员最终被法院以操纵证券市场罪判处了有期徒刑。

五、后续监管与防范

1. 后续监管：在案件处理完毕后，监管机构还会对涉案人员或机构进行持续的监管，确保其不再从事类似的违法行为。

2. 防范机制：同时，监管机构还会加强市场监管和防范机制的建设，提高市场透明度和公正性，减少操纵股价等违法行为的发生。

综上所述，操纵股价案子的立案过程是一个涉及多个环节和多个机构的复杂程序。它要求监管机构具备高度的专业性和严谨性，以确保案件的公正处理和市场的稳定运行。