工程欠款并非只有公司盖章才有效，其有效性取决于多种因素，以下从不同角度进行分析：

一、公司盖章的法律效力

公司盖章在工程欠款中确实是一个重要的证据形式，它代表了公司对欠款事实的确认和承担还款责任的意愿。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。因此，如果工程欠款以书面合同或欠条的形式存在，并且加盖了公司的公章，那么这份文件在法律上通常具有较高的证明力。

二、其他有效证据形式

然而，工程欠款的有效性并不仅仅依赖于公司盖章。在实际操作中，还存在其他多种证据形式可以证明欠款事实，例如：

1. 签字确认：如果欠款文件上有公司法定代表人或授权代表的签字，同样可以视为公司对欠款事实的确认。签字与盖章在法律上具有同等的效力，都是对公司意愿的表达。
2. 交易习惯或行业惯例：在某些情况下，即使没有明确的书面合同或欠条，但根据双方之间的交易习惯或行业惯例，也可以推断出欠款事实的存在。例如，长期合作的双方可能通过口头协议或行为习惯来确认欠款和还款事宜。
3. 其他辅助证据：如转账记录、发票、送货单、验收单等，这些证据可以与欠款文件相互印证，形成完整的证据链，从而证明欠款事实的真实性和合法性。

三、特殊情况下的欠款有效性

1. 表见代理：如果欠款文件上签字的人并非公司法定代表人或授权代表，但相对方有理由相信其有权代表公司签字（例如，该人长期以公司名义进行业务活动），那么根据表见代理的原则，公司仍可能需要承担还款责任。
2. 公司合并、分立或注销：在公司发生合并、分立或注销等变更情况时，原公司的债权债务通常由变更后的公司或清算组承担。因此，即使欠款文件上加盖的是原公司的公章，但只要变更后的公司或清算组确认了欠款事实，那么欠款仍然有效。

四、法律建议

1. 完善证据链：在处理工程欠款问题时，建议尽可能收集多种形式的证据，以形成完整的证据链。这不仅可以提高欠款追讨的成功率，还可以在发生纠纷时提供有力的法律支持。
2. 及时主张权利：如果发现工程欠款问题，应及时与对方沟通协商，并尽快通过法律途径主张权利。避免因为拖延时间而导致证据灭失或对方转移财产等不利情况的发生。
3. 咨询专业律师：在处理复杂的工程欠款问题时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供针对性的法律建议和解决方案，帮助您更好地维护自己的合法权益。

综上所述，工程欠款的有效性并不仅仅依赖于公司盖章，而是取决于多种因素的综合作用。在处理此类问题时，应综合考虑各种证据形式和法律原则，以形成有力的法律支持。如果您有任何关于工程欠款或其他法律问题的疑问，可以直接向我咨询。