您好，关于您提出的“超员40%扣多少分和罚款多少”的问题，我会根据您提供的参考信息，结合相关法规，给出清晰、详细且有深度的解答。

首先，我们需要明确的是，超员处罚的具体扣分和罚款标准会根据车辆类型的不同而有所差异。以下是根据您提供的参考信息整理的处罚标准：

一、私家车（7座以下小型汽车）

• 超员40%：根据新交规，私家车超员40%将扣罚6分，并罚款200元。

二、7座以上载客汽车

• 超员20%-50%：一次记6分。虽然具体罚款金额未直接提及，但根据《道路交通安全法》的相关规定，公路客运车辆载客超过额定乘员的，将处二百元以上五百元以下罚款；超过额定乘员百分之二十的，处罚将更为严厉，可能处五百元以上二千元以下罚款。
• 超员50%～100%：一次记9分，罚款标准同样遵循上述《道路交通安全法》的规定。

三、载货汽车

• 超载30%-50%：扣3分。关于罚款，根据《道路交通安全法》，货运机动车超过核定载质量的，将处二百元以上五百元以下罚款；超过核定载质量百分之三十的，处五百元以上二千元以下罚款。

四、法律依据

• 《道路交通安全法》第九十二条明确规定：公路客运车辆载客超过额定乘员的，处二百元以上五百元以下罚款；超过额定乘员百分之二十或者违反规定载货的，处五百元以上二千元以下罚款。货运机动车超过核定载质量的，也有相应的罚款规定。

五、总结

综上所述，对于超员40%的情况，如果是私家车（7座以下小型汽车），将扣罚6分并罚款200元。如果是7座以上载客汽车或载货汽车，扣分和罚款标准将有所不同，且可能更为严厉。因此，建议驾驶员严格遵守交通规则，避免超员或超载行为的发生，以确保行车安全并避免不必要的法律处罚。