检察院不起诉的案子，在大多数情况下是不会有案底的。但具体是否留下案底，还需根据案件的具体情况和不起诉的原因来判断。以下是对这一问题的详细分析：
法定不起诉（绝对不起诉）
- 法律规定：根据《刑事诉讼法》第十六条，若案件存在情节显著轻微、危害不大不认为是犯罪、已过追诉时效、经特赦令免除刑罚、依照刑法告诉才处理的犯罪没有告诉或撤回告诉、犯罪嫌疑人或被告人死亡，以及其他法律规定免予追究刑事责任等情形，人民检察院应当作出不起诉决定。
- 对案底的影响：在此类情况下，由于行为本身不构成犯罪或依法不应追究刑事责任，因此不会留下任何案底。这相当于法律上对行为人的“无罪”认定，自然不会产生犯罪记录。
酌定不起诉（相对不起诉）
- 法律规定：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者可以免除刑罚的案件，人民检察院有权作出不起诉决定。这通常涉及自首、立功、犯罪预备、犯罪中止等从轻、减轻或免除处罚的情节。
- 对案底的影响：尽管此类案件认定了犯罪嫌疑人的行为构成犯罪，但由于情节轻微且不需要判处刑罚或可免除刑罚，因此通常也不会产生案底。这是法律对犯罪情节轻微者的宽容处理，旨在给予其改过自新的机会。
存疑不起诉（证据不足不起诉）
- 法律规定：依据《刑事诉讼法》第一百七十五条第四款，对于经过两次补充侦查后仍然认为证据不足、不符合起诉条件的案件，人民检察院应当作出不起诉决定。
- 对案底的影响：在此类案件中，由于证据不足无法确定犯罪嫌疑人有罪，因此不会留下案底。但需要注意的是，如果未来发现新证据足以证明犯罪嫌疑人构成犯罪，检察院可能重新提起公诉，若被判定有罪则会留下案底。
特殊情况与注意事项：
- 行政违法记录：即使检察院作出不起诉决定，如果行为涉及行政违法，如违反《治安管理处罚法》等，仍可能留下行政处罚记录。这与法律意义上的案底不同，但在某些场合下也可能对个人产生影响。
- 特定行业或职业影响：在某些行业或职业中，即使检察院作出不起诉决定，相关单位可能根据内部规定进行一定处理或记录。这同样与法律意义上的案底不同，但也可能对个人职业发展造成一定影响。
- 后续情况变化：如前所述，如果未来发现新证据足以证明犯罪嫌疑人构成犯罪，检察院可能重新提起公诉。若被判定有罪，则会留下犯罪记录。
总结与建议：
检察院的不起诉决定在大多数情况下意味着案件在刑事层面得到解决，且不会留下犯罪记录。然而，具体情况还需根据案件的具体情况和法律规定来判断。如果你或你身边的人遇到类似情况，有任何疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供准确的法律意见和帮助。