结论：在借了2万还了1万的情况下就开具了结清证明，这种情况可能涉及多种原因，包括但不限于双方协商一致、误解或误操作、以及存在其他特殊约定等。下面我将从这几个方面进行详细分析。

1. 双方协商一致：

   • 在民间借贷中，双方当事人有权根据实际情况和自身需求，对借款的偿还方式、时间、金额等进行协商。如果出借人和借款人在还款过程中，经过友好协商，一致同意在借款人偿还1万元后，就视为借款已经全部结清，并出具了结清证明，那么这种情况是合法的，也是有效的。

2. 误解或误操作：

   • 另一种可能是，在开具结清证明的过程中，由于出借人或借款人的误解或误操作，导致在借款人仅偿还1万元的情况下就出具了结清证明。例如，出借人可能误以为借款人已经偿还了全部借款，或者借款人可能利用出借人的疏忽，故意误导出借人出具结清证明。这种情况下，如果出借人发现后，可以与借款人协商撤销或更正结清证明，或者通过法律途径维护自己的权益。

3. 存在其他特殊约定：

   • 双方之间可能还存在其他未明确说明的特殊约定。例如，借款人可能向出借人提供了某种形式的担保或抵押物，出借人同意在借款人偿还部分借款后，就出具结清证明，并保留对担保物或抵押物的追索权。或者，双方可能约定了某种形式的分期还款计划，其中包含了在偿还一定金额后出具结清证明的条款。

法律建议：

• 对于出借人而言，在出具结清证明前，务必确认借款人已经偿还了全部借款，或者双方已经就剩余借款的偿还方式、时间等达成了明确的一致意见。如果出借人发现结清证明存在误解或误操作，应及时与借款人协商撤销或更正，并保留好相关证据，以备不时之需。
• 对于借款人而言，如果确实存在尚未偿还的借款，应主动与出借人沟通，明确剩余借款的偿还方式和时间，避免因为误解或误操作而引发不必要的法律纠纷。如果借款人已经偿还了部分借款，但出借人仍然要求出具结清证明，借款人应谨慎对待，确保自己的权益不受损害。

可能的法律后果：

• 如果出借人因为误解或误操作而出具了结清证明，但借款人实际上并未偿还全部借款，那么出借人仍然有权要求借款人偿还剩余借款，并可能通过法律途径追究借款人的违约责任。
• 如果借款人利用出借人的疏忽或误解，故意误导出借人出具结清证明，并试图逃避剩余借款的偿还责任，那么借款人可能构成欺诈行为，需要承担相应的法律责任。

总之，在民间借贷中，双方应保持谨慎和诚信的态度，确保借款和还款过程的合法性和有效性。如果有任何疑问或不确定的地方，建议及时咨询专业律师，以维护自己的合法权益。如果你有进一步的法律问题，可以直接向我咨询。