核心结论：施工单位超工期后提出清单漏项，需分情况处理，关键在于判断漏项责任归属及合同约定，具体如下：

1. 若清单漏项责任在建设单位（如设计变更、工程量清单编制错误）
   根据《建设工程工程量清单计价规范》（GB50500-2013）第9.3条，因设计变更导致工程量清单缺项或项目特征描述与实际不符的，应由建设单位承担调整责任。施工单位可按以下步骤主张权利：

   • 第一步：固定证据：收集施工图纸、变更通知、工程量清单、现场签证单等材料，证明漏项系因建设单位原因导致；
     
   • 第二步：提出索赔：在合同约定的索赔期限内（通常为28天），向建设单位提交书面索赔报告，明确漏项内容、工程量及费用计算依据；
     
   • 第三步：协商或诉讼：若建设单位拒绝调整，可依据《民法典》第803条（发包人未按照约定提供条件导致停工、窝工的，承包人有权要求赔偿）提起诉讼或仲裁，要求支付漏项工程款及逾期利息。
     

2. 若清单漏项责任在施工单位（如报价时未仔细核对、未提出异议）
   根据《建设工程施工合同（示范文本）》（GF-2017-0201）第10.1条，承包人应对工程量清单的准确性和完整性负责。此时施工单位可能面临以下风险：

   • 工期延误责任：若漏项导致工期延长，建设单位可依据合同约定主张逾期竣工违约金（通常为合同价款的日万分之三至万分之五）；
     
   • 费用承担风险：施工单位需自行承担漏项部分的工程成本，除非能证明漏项系因建设单位提供的资料存在重大错误或隐瞒。
     

3. 若合同未明确约定漏项责任
   根据《民法典》第510条（合同生效后，当事人就质量、价款等未约定或约定不明的，可协议补充；不能达成补充协议的，按合同相关条款或交易习惯确定），可参考以下原则处理：

   • 公平原则：若漏项非双方过错导致（如不可抗力、第三方原因），可按实际成本加合理利润协商调整；
     
   • 行业惯例：参考当地建设主管部门发布的计价依据或类似案例，确定漏项费用的分担比例。
     

建议行动：

• 立即核对合同条款，明确双方权利义务；
  
• 委托第三方造价机构对漏项工程量及费用进行鉴定；
  
• 若协商无果，可在诉讼时效内（3年）向法院起诉或申请仲裁。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件细节。