结论：公司账户上被保全60万后，剩余的40万能否取出，需根据保全的具体范围、保全裁定内容以及账户资金性质等多方面因素综合判断。以下从不同角度进行分析：

一、保全范围与裁定内容的影响

1. 保全范围明确且仅针对特定资金：

   • 若保全裁定明确仅对公司账户中的60万资金进行保全，且该裁定未涉及账户中的其他资金，则理论上剩余的40万资金是可以取出的。但实际操作中，银行或相关金融机构可能会因账户被保全而采取一定的限制措施，如冻结整个账户（尽管法律上可能仅保全部分资金），此时需与银行或金融机构沟通，确认是否可以取出未被保全的部分资金。

2. 保全范围模糊或涉及整个账户：

   • 若保全裁定未明确保全的具体金额，而是对整个账户进行了保全，或者保全裁定中虽明确了金额但银行或金融机构实际操作中冻结了整个账户，则剩余的40万资金可能无法直接取出。此时，公司需向法院提出异议，要求明确保全范围或解除对未保全部分资金的冻结。

二、账户资金性质的影响

1. 资金性质与保全无关：

   • 若公司账户中的资金性质与保全事项无关，如该40万资金为特定项目专用资金、已设定担保的资金等，且能提供充分证据证明其与保全事项无关，则公司可以向法院申请解除对该部分资金的保全，从而取出资金。

2. 资金性质与保全相关：

   • 若公司账户中的资金性质与保全事项相关，如该40万资金同样属于保全裁定中应保全的财产范围，则该部分资金无法取出。

三、实际操作建议

1. 查阅保全裁定：

   • 公司应首先查阅保全裁定，明确保全的具体范围、金额以及保全的财产类型，以此判断剩余40万资金是否受保全影响。

2. 与银行或金融机构沟通：

   • 在确认保全范围后，公司应与银行或相关金融机构沟通，了解账户的实际冻结情况，以及是否可以取出未被保全的部分资金。

3. 向法院提出异议或申请：

   • 若公司认为保全裁定存在错误或保全范围不明确，可以向法院提出异议，要求明确保全范围或解除对未保全部分资金的冻结。同时，若公司能提供充分证据证明剩余40万资金与保全事项无关，也可以向法院申请解除对该部分资金的保全。

法律背景与建议：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，保全限于请求的范围，或者与本案有关的财物。因此，保全裁定应明确保全的具体范围和金额。若公司认为保全裁定存在错误或不当，有权向法院提出异议或申请复议。在实际操作中，公司应积极与银行、法院沟通，确保自身合法权益不受损害。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。