城中村楼顶加盖通信基站是否违法，需视具体情况而定，其合法性取决于是否满足一系列法律法规和程序要求。以下从多个角度进行详细分析：
规划许可方面：
- 根据《中华人民共和国城乡规划法》，在城市、镇规划区内进行任何工程建设，包括楼顶安装基站，必须向城乡规划主管部门申请办理建设工程规划许可证。若城中村属于城市或镇规划区，且加盖基站未获得相关审批，则构成违法建设，可能面临责令改正、罚款等行政处罚。
无线电管理审批方面：
- 依据《中华人民共和国无线电管理条例》，设置、使用无线电台（站）需向无线电管理机构提出申请并取得无线电台执照。若加盖基站未获得无线电管理机构的许可，擅自设置、使用无线电台（站），则违反了无线电管理规定，可能面临相应的行政处罚。
业主同意方面：
- 城中村楼顶通常属于业主共有部分。根据《中华人民共和国民法典》，涉及建筑物共有部分的重大事项需经专有部分面积四分之三以上且参与表决人数四分之三以上的业主同意。若加盖基站未取得相关业主的合法授权，则侵犯了业主的共有权利，业主有权要求拆除或获得补偿。
环保与安全标准方面：
- 基站的电磁辐射需符合国家规定的《电磁环境控制限值》（GB 8702-2014），确保不会对周围环境和居民健康造成危害。同时，基站的建设和运行还需遵守相关技术标准和安全规范。若基站电磁辐射超标或存在安全隐患，相关部门有权责令限期整改；逾期未整改或整改后仍不达标的，可能会被依法关停，并可能承担民事赔偿责任。
若城中村楼顶加盖通信基站满足以下条件，则通常被认为是合法的：
- 已获得城乡规划主管部门的审批，取得建设工程规划许可证；
- 已获得无线电管理机构的许可，取得无线电台执照；
- 已支付使用费给建筑物的产权人或其他权利人（若适用）；
- 已取得相关业主的合法授权；
- 基站的电磁辐射符合国家标准，且建设和运行符合相关技术标准和安全规范。
若认为城中村楼顶加盖的通信基站设置不符合法律法规或侵害了自身权益，可以采取以下措施：
- 向当地无线电管理部门、城乡规划部门投诉，要求拆除违规基站；
- 如协商无果，可通过司法途径向人民法院起诉，请求停止侵害、恢复原状并赔偿损失。
综上所述，城中村楼顶加盖通信基站的合法性需综合考虑多个因素。在决定加盖前，建议详细咨询当地相关部门，确保所有程序合法合规，以避免潜在的法律风险和经济损失。若您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。