关于被告申请证人出庭的费用承担问题，我可以给你明确的解答。

结论：被告申请证人出庭的费用，一开始是由申请证人出庭的那一方当事人（即被告）先垫付。等案件结束后，这笔费用由败诉方来承担。如果双方都有责任，就按照各自的责任比例去分担。

分析说明：

1. 费用垫付：根据《民事诉讼法》的相关规定，证人因履行出庭作证义务而产生的交通、住宿、就餐等必要费用，以及因误工而损失的钱，一开始是由申请证人出庭的那一方当事人先垫付。在这个问题中，如果被告申请了证人出庭，那么被告就需要先垫付这些费用。

2. 费用承担：案件结束后，根据判决结果，这些费用将由败诉方来承担。这意味着，如果被告最终败诉，那么他垫付的证人出庭费用将由他自己承担。如果原告败诉，那么这些费用将由原告承担。

3. 责任分担：如果双方都有责任，那么费用将按照各自的责任比例去分担。这体现了法律上的公平原则，即根据双方的过错程度来分配责任。

特殊场景：

• 如果当事人没有申请证人出庭，但是人民法院通知证人作证了，那么这笔费用将由人民法院先垫付。
• 在司法实践中，对于“由败诉方负担”的理解可能会存在一些复杂情况。例如，如果原告的诉讼请求虽然获得支持，但与证人证言并无关联性，或者出庭的数名证人中，仅有一名证人的证言被采信，这时费用的承担可能需要根据具体情况进行裁定。

行动建议：

• 如果你作为被告需要申请证人出庭作证，建议你在申请前充分了解相关法律规定和费用承担原则。
• 在案件审理过程中，积极配合法院和对方当事人进行证据交换和质证工作，以确保你的权益得到充分保障。

希望这个解答能够帮助你明确被告申请证人出庭费用的承担问题。如果你还有其他法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。