在高速公路上，重型货车限速90km/h而实际行驶速度为93km/h，通常会被认定为超速行驶，但一般不会面临严重的处罚，具体处罚情况需根据超速比例和当地交通法规来确定。以下是对此问题的详细分析：

1. 超速比例的计算：

   • 超速比例 = （实际速度 - 限速）/ 限速 × 100%
   • 在本例中，超速比例 = （93 - 90）/ 90 × 100% ≈ 3.33%

2. 根据超速比例确定处罚：

   • 一般情况：根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，超速未达20%的，通常会被处以警告或者二十元以上二百元以下罚款，并可能扣分（具体扣分情况需根据当地交通法规确定，一般可能扣3分或更少，也有不扣分的情况）。
   • 特殊情况：如果超速行为发生在特定路段（如桥梁、隧道、急弯等）或特定时段（如恶劣天气、交通拥堵时），或者驾驶员有其他违法行为（如酒驾、毒驾等），处罚可能会更加严厉。

3. 地区差异：

   • 不同地区的交通法规可能有所不同，对超速行为的处罚也可能存在差异。因此，在具体情况下，需要参考当地的交通法规来确定处罚。

4. 建议：

   • 驾驶员应严格遵守交通法规，按照限速行驶，以确保行车安全。
   • 如果因超速被处罚，应及时处理违章记录，避免产生不必要的麻烦。

总结来说，重型货车在高速公路上限速90km/h而实际行驶速度为93km/h，通常会被认定为超速行驶，但处罚一般较轻。具体处罚情况需根据超速比例和当地交通法规来确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。