合同只有一份且一方三年后偷偷签字，该合同一般无效，但具体需结合实际情况判断。以下从不同角度为你详细分析：
合同生效的基本条件
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同生效一般需要满足以下几个条件：
- 行为人具有相应的民事行为能力：即签订合同的双方都需要具备能够理解合同内容并承担相应法律责任的能力。如果一方或双方不具备相应的民事行为能力，那么合同可能无效或可撤销。
- 意思表示真实：合同双方的意思表示需要真实、自愿，没有受到欺诈、胁迫等不正当手段的影响。如果一方在签订合同时存在意思表示不真实的情况，那么合同可能无效或可撤销。
- 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：合同的内容需要合法，不能违反国家的法律法规，也不能违背社会的公序良俗。如果合同内容违法或违背公序良俗，那么合同无效。
关于“偷偷签字”对合同效力的影响
从意思表示真实性的角度：
- 如果一方在三年后偷偷签字，且另一方对此并不知情，那么这种签字行为很可能构成对另一方意思表示的欺诈或隐瞒。因为另一方在签订合同时，并没有与偷偷签字的一方达成真正的合意。
- 在这种情况下，被欺诈或隐瞒的一方有权请求人民法院或者仲裁机构撤销该合同，或者主张合同无效。
从合同成立与生效的时间点角度：
- 合同一般自双方签字或盖章时成立并生效。但如果一方偷偷签字，且另一方并未在合同上签字或盖章，那么合同实际上并未成立，更谈不上生效。
- 即使合同上只有一方的签字，但如果另一方以实际行动履行了合同的主要义务，且对方接受的，那么合同也可能被视为成立并生效。但这种情况并不适用于“偷偷签字”的情形，因为“偷偷签字”往往伴随着另一方的不知情。
从诉讼时效的角度（虽然不直接影响合同效力，但影响权利主张）：
- 如果一方认为合同无效或可撤销，并希望通过法律途径解决争议，那么需要注意诉讼时效的问题。一般来说，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。但在这个案例中，由于“偷偷签字”的行为可能构成欺诈或隐瞒，所以诉讼时效的起算点可能会从被欺诈或隐瞒的一方知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
特殊情况下的合同效力
- 如果双方在合同中约定了某些特殊条款，如“本合同自双方签字后生效，但一方签字后需经另一方确认后合同方为有效”等，那么这种约定将影响合同的生效条件。在这种情况下，即使一方偷偷签字，但如果另一方并未确认，那么合同仍然无效。
建议：如果你遇到了类似的情况，建议你首先收集相关证据，如合同文本、签字样本、通信记录等，以证明另一方的“偷偷签字”行为。然后，你可以咨询专业律师（当然，你可以直接向我咨询，我专注于合同纠纷领域），根据你的具体情况和证据，为你提供更具体的法律建议和解决方案。