交警在检察院认定醉驾血液鉴定无效的情况下，可以申请备用血鉴定，但需满足一定条件并遵循法定程序。以下从多个角度进行分析：

1. 法律依据与程序要求
   根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，血液酒精含量鉴定是认定醉驾的核心证据。若原鉴定因程序违法（如采血过程不规范、保存不当、鉴定机构资质不符等）被检察院认定无效，交警部门作为侦查机关，有权重新启动鉴定程序。此时需注意：
   

• 重新鉴定的启动主体：交警部门可自行决定或根据检察院的建议，委托其他具备资质的鉴定机构进行备用血鉴定；
  
• 备用血样的合法性：若原采血时留存了备用血样（如分装保存），可直接使用；若未留存，需重新采血，但需确保采血程序合法（如由医护人员操作、使用无菌容器、全程录音录像等）。

1. 重新鉴定的条件与限制
   

• 鉴定无效的具体原因：若原鉴定因“血样被污染”“鉴定方法错误”等客观原因无效，重新鉴定通常无障碍；但若因“鉴定人资质问题”或“程序严重违法”导致无效，需更换鉴定机构或鉴定人；
  
• 犯罪嫌疑人权利保障：根据《刑事诉讼法》，犯罪嫌疑人有权对鉴定意见提出异议，并申请补充鉴定或重新鉴定。若交警部门直接启动备用血鉴定，需告知犯罪嫌疑人权利，并允许其提出异议或申请参与鉴定过程。

1. 实践中的操作建议
   

• 证据固定与程序合规：交警部门在重新鉴定前，需固定原鉴定无效的证据（如检察院的《鉴定意见通知书》），并确保重新鉴定的程序完全合规（如委托书、鉴定机构资质证明、鉴定人签名等）；
  
• 与检察院的沟通：为避免程序争议，建议交警部门在启动备用血鉴定前，与检察院充分沟通，明确重新鉴定的必要性和合法性，确保鉴定意见能被后续诉讼程序采纳。

总结：交警部门在原醉驾血液鉴定被认定无效后，有权申请备用血鉴定，但需严格遵循法定程序，确保血样合法、鉴定机构资质合规，并保障犯罪嫌疑人的权利。若您涉及具体案件，可进一步向我咨询程序细节或证据固定问题。