是可以与村组织签订代耕代种协议的。以下是对此问题的详细解答：
首先，从法律法规的角度来看，根据《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国农村土地承包法》和《基本农田保护条例》等法律法规，是禁止任何单位和个人闲置、撂荒耕地的。对于因各种原因（如弃农经商、长期外出务工、家中缺少劳动力或因疫情未返乡等）无法耕种，但又不愿意放弃土地承包权的农户，法律是鼓励他们委托亲友、种植大户或新型农业经营主体进行代耕代种的。村组织，作为农村集体经济组织的一种形式，在符合法律法规的前提下，是可以作为代耕代种的受托方的。
其次，从实际操作的角度来看，已经有一些地方（如甘肃省会宁县中川镇高庙村）的村组织与农户之间签订了代耕代种合同，并明确了双方的权利和义务。这些合同通常包括代耕代种期限、土地用途、双方的权利义务、其他约定等内容，为双方提供了明确的指导和保障。这表明，与村组织签订代耕代种协议是具有可行性和实践性的。
再者，从政策支持的角度来看，一些地方政府（如安徽省）为了规范农业生产托管服务市场行为，维护广大农户和服务组织合法权益，还制定了农业生产托管服务合同示范文本，并鼓励农业生产托管服务当事人结合实际使用或参照示范文本订立合同。这进一步说明了政府对于代耕代种等农业生产托管服务的支持和鼓励。
建议：
综上所述，与村组织签订代耕代种协议是可行的，但需要确保协议内容符合法律法规和政策要求，并明确双方的权利和义务。