结论前置：关于五天年假休了三天，剩下两天是否还发工资的问题，这主要取决于您剩余的年假是正常休假、调休还是加班且未获得调休的情况。以下是具体分析：

1. 正常休假或调休：

   • 如果您休年假是按照公司的正常休假安排或者调休安排进行的，那么剩余的两天年假，您即使未休，也不应被视为缺勤，公司应当按照您正常的工资标准支付这两天的工资。年假是劳动者的合法权益，公司无权因您未休完年假而扣减工资。

2. 加班且未获得调休：

   • 如果在年假期间，公司因工作需要安排您加班，并且没有为您安排调休，那么根据《中华人民共和国劳动法》的规定，公司需要支付您加班费。具体来说，如果是工作日加班，需支付不低于工资的150%的工资报酬；如果是休息日加班且未安排补休，需支付不低于工资的200%的工资报酬；如果是法定节假日加班，则需支付不低于工资的300%的工资报酬。但年假通常不属于法定节假日，所以主要参考工作日和休息日的加班费标准，具体还需看年假与周末或法定节假日的重合情况。不过，就年假本身而言，若未休完且非因劳动者原因，公司一般应按正常工资支付，而非加班费，除非有特别的加班安排。

3. 劳动者主动放弃剩余年假：

   • 如果您主动放弃剩余的两天年假，并且公司没有因此给您安排额外的工作或加班，那么公司可能不需要为这两天支付额外的工资。但这种情况较为特殊，且需要您与公司有明确的书面或口头协议，表明您自愿放弃剩余年假。

法律建议：

• 如果您发现公司因您未休完年假而扣减工资，或者未按照法律规定支付加班费，您首先可以尝试与公司进行协商沟通，要求公司纠正错误做法。
• 如果协商不成，您可以向当地劳动监察行政部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

可能的后果：

• 如果公司违反法律规定扣减您的工资或未支付加班费，您有权要求公司补发工资和加班费，并可能获得相应的经济补偿。
• 同时，公司也可能因违反劳动法律法规而面临劳动监察部门的处罚。

如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议。