在交通事故申请复核期间，肇事车辆是否会被扣留，这主要取决于事故的具体情况以及交警部门的处理决定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、复核申请与车辆扣留的直接关系

复核申请是当事人对交通事故责任认定不服时，向上级公安机关交通管理部门提出的一种救济途径。而车辆扣留则是交警部门在处理交通事故时，根据事故情况采取的一种行政强制措施。复核申请本身并不直接决定车辆是否会被扣留。

二、车辆扣留的法定情形

根据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关规定，交警部门在以下情形下可以扣留车辆：

1. 未悬挂机动车号牌，未放置检验合格标志、保险标志，或者未随车携带行驶证、驾驶证的；
2. 具有使用伪造、变造或者其他车辆的机动车登记证书、号牌、行驶证、检验合格标志、保险标志嫌疑的；
3. 未按照国家规定投保机动车交通事故责任强制保险的；
4. 公路客运车辆或者货运机动车超载的；
5. 机动车有被盗抢嫌疑的；
6. 机动车有拼装或者达到报废标准嫌疑的；
7. 未申领《剧毒化学品公路运输通行证》通过公路运输剧毒化学品的；
8. 非机动车驾驶人拒绝接受罚款处罚的；
9. 发生道路交通事故，因收集证据的需要，公安机关交通管理部门可以依法扣留事故车辆。

在交通事故中，如果交警部门认为需要收集证据，如车辆痕迹、行车记录仪数据等，就可能会扣留肇事车辆。这种扣留与是否申请复核无关，而是基于事故处理的需要。

三、复核期间车辆扣留的特殊情况

如果事故责任认定已经作出，且当事人已经申请了复核，但在复核期间，交警部门发现需要进一步收集证据以支持或修正原责任认定，那么交警部门仍然有权扣留车辆。这种扣留是为了确保事故处理的公正性和准确性。

四、法律建议

1. 如果车辆被扣留：当事人应配合交警部门的工作，提供必要的协助和证据。同时，可以了解扣留的具体原因和期限，以便做好后续安排。
2. 如果对责任认定不服：应及时向上级公安机关交通管理部门提出复核申请，并附上相关证据和理由。复核申请应在收到责任认定书之日起三日内提出。
3. 在复核期间：当事人应保持与交警部门的沟通，及时了解事故处理的进展和结果。如果车辆被扣留且影响正常生活或工作，可以尝试与交警部门协商解决方案。

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