刑事案件立案三年后，在特定条件下，虽然不能直接“转化”为行政案件，但可能不再追究刑事责任，转而由行政机关进行行政处罚。以下是对这一问题的详细分析：
一、刑事案件与行政案件的基本区别
刑事案件和行政案件是两种性质完全不同的案件类型。刑事案件主要涉及犯罪行为的侦查、起诉、审判和执行，旨在追究犯罪嫌疑人的刑事责任；而行政案件则涉及行政机关与公民、法人或其他组织之间的争议，如行政处罚、行政许可等，旨在解决行政争议和维护行政管理秩序。
二、刑事案件可能不再追究刑事责任，转而行政处罚的情形
情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条第一项以及《中华人民共和国刑法》第十三条的规定，如果犯罪嫌疑人的行为情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪，那么已经立案的刑事案件应当撤销，或者不起诉，或者终止审理。此时，如果行为违反了行政法规，行政机关可以依法进行行政处罚。例如，原本以盗窃罪立案侦查的案件，后经调查发现嫌疑人盗窃财物价值未达到盗窃罪的入罪标准，但其行为仍违反了《治安管理处罚法》，此时可由公安机关依据治安管理处罚相关规定对行为人进行处罚。
犯罪已过追诉时效期限：
- 根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条第二项的规定，如果犯罪已过追诉时效期限，那么已经立案的刑事案件也应当撤销，或者不起诉，或者终止审理。在这种情况下，如果行为违反了行政法规，且行政机关认为有必要进行处罚的，可以依法进行行政处罚。
其他依法不追究刑事责任的情形：
- 除了上述两种情形外，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第十六条的其他规定，如经特赦令免除刑罚的、犯罪嫌疑人死亡的等，如果案件已经立案侦查，但后来发现不符合刑事案件标准，也应当撤销案件，或者不起诉，或者终止审理。在这些情形下，如果行为违反了行政法规，行政机关同样可以依法进行行政处罚。
三、刑事案件立案三年后的特殊考虑
对于刑事案件立案三年后的情况，虽然时间因素本身并不直接决定案件是否可以转为行政案件处理，但长时间未结案可能意味着案件存在某些特殊情况，如证据不足、犯罪嫌疑人逃匿等。在这些情况下，如果经过进一步侦查、审查等程序，发现犯罪嫌疑人的行为不构成刑法所规定的犯罪，或者犯罪已过追诉时效期限等，那么案件可能不再追究刑事责任，转而由行政机关进行行政处罚。
四、实际操作中的注意事项
办案机关的判断：
- 由办案机关根据案件事实和法律规定进行判断，确定案件是否符合不再追究刑事责任、转而进行行政处罚的条件。
撤销或终止刑事程序：
- 对于符合不再追究刑事责任条件的案件，办案机关应当依法撤销案件、不起诉或终止审理，确保刑事程序的合法终结。
移送行政部门处理：
- 在撤销或终止刑事程序后，办案机关应当及时将案件线索和相关材料移送有管辖权的行政部门，以便行政部门按照行政程序予以处理。
保障当事人权益：
- 在整个过程中，必须确保当事人的合法权益得到保障。例如，及时告知当事人案件性质的转变、听取其陈述和申辩、确保其享有相应的救济途径等。
总结来说，刑事案件立案三年后，在特定条件下可能不再追究刑事责任，转而由行政机关进行行政处罚。但这一过程需要严格遵循相关法律法规和程序规定，确保案件处理的合法性和合理性。如果您对此类问题存在疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。