代持人代持股票的份额发生变化时，协议的撰写需根据变化原因和双方协商结果进行，以下是具体撰写要点及示例：

1. 明确变化原因：

   • 首先要确定股票份额变化的具体原因，如因公司增发、配股、股权转让、代持人部分或全部转让代持权益等。
   • 在协议中应清晰描述变化的原因，以便后续可能出现的争议解决。

2. 描述变化前后的份额：

   • 详细列出变化前代持人代持的股票数量、比例及对应的权益。
   • 同样详细列出变化后代持人代持的股票数量、比例及对应的权益。

3. 双方协商与确认：

   • 强调双方已就股票份额的变化进行了充分协商，并达成一致意见。
   • 可以附上双方的签字或盖章，以证明协议的合法性和有效性。

4. 法律条款与责任：

   • 根据变化原因，可能需要调整或新增相关的法律条款，如保密条款、违约责任、争议解决方式等。
   • 确保所有条款均符合相关法律法规的规定，避免出现违法或无效条款。

示例协议条款：

“鉴于：

1. 甲方（实际出资人）与乙方（代持人）于XXXX年XX月XX日签订了《股票代持协议》，约定乙方代甲方持有XX公司XX%的股份。

2. 现因XX原因（如公司增发、配股、股权转让等），双方经协商一致，同意对乙方代持的股票份额进行调整。

现双方就股票份额变化事宜达成如下协议：

一、变化前乙方代持的股票份额：乙方代甲方持有XX公司XX%的股份，共计XX股。

二、变化后乙方代持的股票份额：经双方协商，乙方现代甲方持有XX公司XX%的股份，共计XX股（或具体描述变化后的股份数量及比例）。

三、双方确认，本次股票份额的变化已充分协商，并达成一致意见。双方应严格遵守本协议的约定，不得擅自变更或解除。

四、本协议未尽事宜，双方可另行签订补充协议。补充协议与本协议具有同等法律效力。

五、本协议自双方签字（或盖章）之日起生效。本协议一式两份，甲乙双方各执一份。”

在撰写协议时，务必确保所有条款的合法性和有效性，并建议双方在签署前对协议内容进行仔细审查。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。