如果经营贷的营业执照已经注销，但贷款还未还清，银行或金融机构有可能会采取多种措施来追回贷款，其中包括可能申请法院查封与贷款相关的财产，包括店铺。不过，具体情况还需根据以下几个角度来分析：

1. 贷款合同条款：

   • 经营贷的合同中通常会明确约定贷款逾期或违约时的处理措施。如果合同中规定了银行在借款人违约时有权查封借款人的财产，那么银行确实有可能采取这一措施。
   • 因此，首先要查看贷款合同的具体条款，了解银行在何种情况下有权采取查封等强制措施。

2. 店铺的所有权与贷款的关系：

   • 如果店铺是作为贷款的抵押物，那么在贷款未还清且出现违约的情况下，银行有权申请法院查封并拍卖该店铺以偿还贷款。
   • 如果店铺并非贷款的抵押物，但借款人的其他财产不足以偿还贷款，银行也可能申请法院对店铺进行查封，但这通常需要更复杂的法律程序。

3. 银行的实际操作：

   • 银行在追讨贷款时，通常会优先考虑与借款人协商还款计划，或者通过其他非诉讼方式解决。查封店铺等强制措施通常是银行在多次协商无果后的最后选择。
   • 因此，即使营业执照已经注销且贷款未还清，借款人仍有机会与银行协商解决问题，避免店铺被查封。

4. 法律程序与救济途径：

   • 如果银行确实申请法院查封了店铺，借款人可以通过法律途径提出异议或申诉，要求法院审查查封的合法性和合理性。
   • 在此过程中，借款人需要聘请专业律师来协助处理法律事务，确保自己的合法权益得到保护。

综上所述，经营贷营业执照注销后贷款未还清，确实存在店铺被查封的风险。但具体是否会被查封，以及查封后的处理方式，都需要根据贷款合同的具体条款、店铺的所有权与贷款的关系、银行的实际操作以及法律程序与救济途径来综合判断。因此，建议借款人在面临此类问题时，及时咨询专业律师，以便更好地了解自己的权利和义务，并寻求合适的解决方案。