通过股东会决定解除股东资格是否合法，需视具体情况而定，但严格遵循法定条件和程序时，可以合法解除特定股东的资格。以下从多个角度详细分析：

一、法律依据与适用条件

根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国公司法〉若干问题的规定（三）》第十七条第一款，有限责任公司的股东若未履行出资义务或抽逃全部出资，并在公司催告后的合理期间内仍未缴纳或返还，公司以股东会决议解除该股东的股东资格，该解除行为通常会被人民法院支持。这一规定明确了取消股东资格的法律基础，并设定了具体的适用条件：

1. 适用对象：仅适用于有限责任公司股东，不适用于股份有限公司股东。股份有限公司的股份具有流通性和公开性，其股东资格的取消存在不同规定。
2. 适用情形：仅限于股东未履行出资义务或抽逃全部出资的情况。部分未履行或抽逃不直接构成取消资格的理由。
3. 前置程序：公司需先催告股东缴纳或返还出资，并给予合理期限。只有在期限内未改正时，方可考虑取消资格。

二、法定程序与注意事项

1. 召集股东会：按照公司章程规定的程序召集会议，明确通知全体股东会议的时间、地点及审议事项，特别是解除特定股东资格的议题。
2. 股东会表决：在会议上，由股东对解除股东资格的决议进行投票。通常，此决议需符合公司章程规定的表决比例，一般要求代表三分之二以上表决权的股东同意。
3. 后续处理：决议通过后，公司需及时办理法定减资程序或由其他股东/第三人缴纳相应出资，并到公司登记机关办理变更登记，将被取消资格的股东从股东名册和工商登记中移除。

三、实际操作中的建议

1. 确保程序合法：在做出取消股东资格的决议时，必须严格遵守公司法及公司章程规定的议事方式和表决程序，确保召集、通知、表决等环节的合规性。任何瑕疵都可能导致法律纠纷，甚至决议被撤销或认定无效。
2. 保障股东权利：在决策过程中，应充分保障被除名股东的申辩权利，确保决议内容的合法性和程序的正当性。
3. 及时后续处理：决议通过后，公司应及时办理法定减资程序或由其他股东或第三人缴纳相应出资，以维持公司资本的稳定性和保护债权人的利益。

四、案例说明

以甲为A有限责任公司的股东为例，甲认缴出资100万元但一直未实际出资。公司多次书面催告甲在3个月内缴纳出资，但甲均未理会。随后，公司依法召开股东大会，经代表三分之二以上表决权的股东通过，作出了解除甲股东资格的决议。在此情况下，若甲向法院请求确认解除行为无效，法院通常不会支持。此案例进一步印证了股东会在特定条件下取消股东资格的合法性与严谨性。

总结：通过股东会决定解除股东资格是一个严肃且复杂的法律过程，必须严格遵守法律规定的条件和程序。在实际操作中，公司应谨慎对待股东资格的取消问题，确保所有行动都符合法律法规的要求。若您在此过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。