公司民事案件处理完毕后仍有“案底”的情况，通常是因为案件信息被记录在了相关司法或行政系统中，这些记录可能因多种原因而保留。以下从几个角度为您详细解释：
司法记录的保留：
- 在民事诉讼中，一旦案件被法院受理并进入诉讼程序，相关的案件信息，如起诉状、答辩状、证据材料、庭审记录、判决书等，都会被法院记录并存档。这些记录是司法活动的重要部分，用于确保司法透明度和可追溯性。
- 即使案件最终以调解、撤诉或判决结案，这些记录也不会被立即删除，而是会保留在法院的档案系统中，以备未来可能的查询或参考。这就是为什么公司即使处理完了民事案件，也可能在相关系统中查到“案底”。
信用信息系统的记录：
- 除了司法系统外，一些信用信息系统，如企业信用信息公示系统、征信机构等，也可能记录公司的涉诉信息。这些系统旨在提供公司的信用状况，帮助其他市场主体了解公司的经营和法律风险。
- 如果公司的民事案件涉及违约、侵权等行为，且这些行为被法院认定并记录在案，那么这些信息就可能被信用信息系统采集并展示，从而影响公司的信用评级和融资能力。
行政监管的记录：
- 在某些情况下，公司的民事案件可能还涉及行政监管部门的关注。例如，如果案件涉及环保、安全、税务等敏感领域，行政监管部门可能会将案件信息纳入其监管范围，并进行记录和跟踪。
- 这些记录可能用于行政监管部门的决策参考，也可能在未来的行政检查或审计中被查阅。
针对您的情况，我建议：
- 了解具体记录内容：首先，您可以向相关司法或行政系统查询具体的记录内容，了解案件被记录的具体原因和范围。
- 评估影响：根据记录内容，评估这些“案底”对公司可能产生的影响，包括信用评级、融资能力、业务合作等方面。
- 采取应对措施：如果“案底”对公司产生了不利影响，您可以考虑采取一些应对措施，如申请更正错误记录、加强公司合规管理、积极履行法院判决等，以改善公司的信用状况和法律风险。
最后，需要强调的是，虽然“案底”可能对公司产生一定影响，但并非不可改变。通过积极应对和合规管理，公司可以逐步改善其信用状况和法律风险，为未来的发展奠定坚实基础。如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。