结论前置：在符合相关法律法规要求的前提下，合同中使用电子印章是完全合法的，且与传统手写签名或盖章具有同等的法律效力。以下从法律依据、使用条件、实际应用注意事项三个维度进行详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国民法典》
- 第四百六十九条明确指出，书面形式不仅限于传统的纸质合同，还包括能够有形地表现所载内容并可以随时调取查用的数据电文。电子合同作为数据电文的一种形式，在满足一定条件下，被视为书面形式，因此可以使用电子印章。
《中华人民共和国电子签名法》
- 第三条确认了电子签名的法律效力，规定在民事活动中，当事人可以约定使用电子签名和数据电文，且不得仅因其形式而否定其法律效力（除非涉及特定排除范围，如婚姻、收养、继承等）。
- 第十四条进一步强调，可靠的电子签名与手写签名或盖章具有同等法律效力。
- 第十三条详细列出了构成可靠电子签名的条件，包括签名制作数据的专有性、控制性、改动可发现性等。当电子印章满足这些条件时，即视为可靠的电子签名。
二、使用条件
电子印章要具有法律效力，需满足以下条件：
- 专有性：电子签名制作数据用于电子签名时，属于电子签名人专有。
- 控制性：签署时电子签名制作数据仅由电子签名人控制。
- 改动可发现性：签署后对电子签名的任何改动能够被发现，且对数据电文内容和形式的任何改动也能够被发现。
三、实际应用注意事项
了解并遵守相关法律法规和技术标准：
- 在使用电子印章签订合同前，应仔细了解并遵守《中华人民共和国民法典》、《中华人民共和国电子签名法》等相关法律法规，以及国家关于电子印章的技术标准和管理规定。
确保电子印章的安全性和可靠性：
- 选择具有合法资质的电子印章制作服务提供商，确保电子印章的制作、存储和使用过程符合安全要求。
- 定期更新电子印章的加密密钥，防止被篡改或盗用。
- 保留完整的电子签约日志，以备查验和证明合同的真实性和完整性。
明确约定使用电子印章的方式和效力：
- 在签订合同时，双方应明确约定使用电子印章的方式和效力，包括电子印章的生成、存储、传输、验证等环节的具体要求。
- 如有必要，可以约定通过第三方电子认证机构进行身份核验和存证，以增强电子印章的可靠性和证明力。
注意特殊领域的限制：
- 尽管电子印章在大多数情况下是合法有效的，但在某些特定领域或行业（如涉及婚姻、收养、继承等人身关系的合同，以及停止供水、供热、供气等公用事业服务的合同），法律规定不适用电子文书。在这些情况下，一般不能使用电子印章。
总结与建议：合同中使用电子印章是完全合法的，并且具有与传统手写签名或盖章同等的法律效力。但在实际操作中，仍需注意遵守相关法律法规和技术标准，确保电子印章的有效性和安全性。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。