劳务派遣公司派遣的员工的工资，一般应由劳务派遣单位发放。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律规定与依据

根据《中华人民共和国劳动合同法》第五十八条，劳务派遣单位是本法所称用人单位，应当履行用人单位对劳动者的义务，这其中包括向被派遣劳动者按月支付劳动报酬。被派遣劳动者在无工作期间，劳务派遣单位也应当按照所在地人民政府规定的最低工资标准，向其按月支付报酬。这一条款明确规定了劳务派遣单位作为用人单位的工资支付责任。

二、劳务派遣关系的本质与工资发放

1. 劳动关系决定工资发放主体：

   • 劳务派遣人员与劳务派遣单位之间建立了劳动关系，并签订了劳动合同。基于劳动关系的存在，用人单位（即劳务派遣单位）有义务按照约定向劳动者支付工资。
   • 例如，小张与某劳务派遣公司签订了劳动合同，并被派遣到一家企业工作。尽管小张在企业实际工作，但他的工资仍应由劳务派遣公司发放，因为小张的劳动关系是与劳务派遣公司建立的。

2. 劳务派遣关系的运作方式：

   • 劳务派遣是一种特殊的用工方式，其中劳务派遣单位作为用人单位，与被派遣劳动者建立劳动关系，并负责管理、培训、发放工资等事务。
   • 用工单位则通过与劳务派遣单位签订劳务派遣协议，使用被派遣劳动者的劳务，并向劳务派遣单位支付包括工资在内的相关费用。

三、实际操作中的工资发放流程

1. 用工单位与劳务派遣单位结算：

   • 用工单位根据劳务派遣协议的约定，将包括被派遣劳动者工资在内的相关费用支付给劳务派遣单位。
   • 例如，某用工单位与劳务派遣单位签订的协议中约定，每月5日前将上月被派遣劳动者的工资总额转账至劳务派遣单位的指定账户。

2. 劳务派遣单位向劳动者发放工资：

   • 劳务派遣单位在收到用工单位支付的费用后，按照与被派遣劳动者签订的劳动合同的约定，按时足额向被派遣劳动者支付工资。
   • 比如，劳务派遣单位应在每月10日前，通过银行转账的方式将工资发放到被派遣劳动者的个人银行账户。

四、特殊情况与劳动者权益保护

1. 特殊情况处理：

   • 虽然在实际操作中可能会出现用工单位代发工资的情况，但这种代发行为需要有明确的约定或特定的安排，并且不改变劳务派遣单位作为工资支付主体的法定责任。
   • 如果因代发工资导致的问题，劳务派遣单位仍需承担最终的法律责任。

2. 劳动者权益保护：

   • 若劳务派遣单位未按时足额发放工资，劳动者可以依法向其主张权利，要求支付工资及相应赔偿。
   • 劳动者在遇到工资问题时，应首先尝试与劳务派遣单位协商解决；协商不成时，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或向人民法院提起诉讼。

综上所述，劳务派遣公司派遣的员工的工资，一般应由劳务派遣单位发放。这是基于法律规定的明确要求以及劳务派遣关系的本质所决定的。在实际操作中，应严格遵守相关法律法规，确保劳动者的合法权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。