合同中注明特殊情况需双方协商时，所需资料需根据具体协商事项及合同类型确定，但通常需准备基础性资料与针对性资料两类。以下为详细说明：

1. 基础性资料

   • 合同原件及补充协议：作为协商的基础法律文件，需提供完整合同文本及已签署的补充协议（如有），以明确双方权利义务框架及特殊条款的具体约定。
   • 身份证明文件：自然人需提供身份证复印件，法人需提供营业执照副本、法定代表人身份证明及授权委托书（如代理人参与协商），以确认协商主体的合法性。
   • 协商事项说明函：需以书面形式明确协商的具体事项（如履行障碍、条款变更需求等）、协商目的及预期结果，避免口头协商因表述不清引发争议。

2. 针对性资料

   • 履行障碍证明：若协商因一方履行困难引发（如资金链断裂、政策变动等），需提供银行流水、政府文件、第三方检测报告等证据，证明障碍的客观性及不可抗力性。
   • 损失计算依据：若协商涉及赔偿或费用调整，需提供损失清单、发票、合同履行记录等，量化损失金额或成本变动，为协商提供数据支持。
   • 行业惯例或专家意见：若协商事项涉及专业领域（如技术标准、市场价格），可提供行业协会文件、专家论证报告等，证明协商方案的合理性或行业通行做法。
   • 沟通记录：若协商前已有初步沟通（如邮件、微信记录），需整理并提交，以证明双方已就协商事项进行过前期交流，避免单方面主张。

注意事项：

• 资料需真实、完整、合法，不得伪造或篡改，否则可能承担法律责任。
• 若协商事项涉及第三方权益（如担保人、共有人），需提前通知第三方并取得其同意，或提供第三方参与协商的书面文件。
• 建议在协商前对资料进行分类整理，并制作资料清单，便于双方快速核对，提高协商效率。

建议：若对资料准备或协商流程有疑问，可直接向我咨询，我将结合具体合同类型及协商事项，提供更详细的指导。