在小区内建库房是否合法，需根据具体情况来判断，不能一概而论。以下从多个角度进行分析：
规划与审批角度：
- 小区内建设库房，首先需符合城市规划要求，并获得当地规划部门、城管部门等相关部门的审批许可。若未经审批擅自建设，将违反城市建设规划管理法规，面临整改或拆除的风险。例如，如果库房的建设占用了公共绿地或改变了小区原有的规划用途，且未经过相关部门的审批，那么这种建设行为就是违法的。
建设标准与规范角度：
- 库房的建设必须严格遵循环保、安全等方面的标准和规范。比如，库房应与居民楼保持一定安全距离，具备良好的通风、防渗、防臭功能，以防止异味扩散和污水渗漏等问题。如果库房的建设不符合这些标准，可能会对周边居民的生活造成不良影响，从而引发法律纠纷。
小区内部程序角度：
- 根据《中华人民共和国民法典》的规定，改建、重建建筑物及其附属设施需经过业主大会或业主委员会的合法程序讨论和同意，代表大多数业主的意愿。如果未经业主大会或业主委员会的同意，擅自在小区内建设库房，将侵犯业主的合法权益，业主有权通过合法途径维护自己的权益，如要求停止建设、拆除库房或赔偿损失等。
土地性质与用途角度：
- 还需要考虑小区土地的性质和用途。如果小区土地是住宅用地，那么建设库房可能改变了土地的用途，违反了土地管理法规。在这种情况下，即使获得了规划部门的审批，也可能因为土地用途的改变而面临法律风险。
法律建议：
- 在小区内建设库房前，应充分了解并遵守相关法律法规和建设标准，确保建设行为合法合规。
- 积极与业主沟通并达成共识，确保库房的建设不会对居民生活造成不良影响。
- 如果涉及土地用途的改变，应提前向相关部门咨询并办理相关手续，确保土地用途的合法性。
可能后果：
- 如果未经审批擅自建设库房，可能面临整改或拆除的风险，并可能承担因此产生的法律责任。
- 如果库房的建设不符合环保、安全等标准，可能对周边居民的生活造成不良影响，从而引发法律纠纷和赔偿问题。
综上所述，小区内建库房的合法性取决于多个因素，包括规划与审批、建设标准与规范、小区内部程序以及土地性质与用途等。因此，在决定建设库房前，务必进行充分的法律咨询和规划，确保建设行为的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。