针对您提出的“驾驶闯红灯两次扣12分怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、处理流程
确认违章信息并缴纳罚款：
- 您需要通过交通管理部门的官方网站、手机APP（如交管12123）或到当地交警大队的违法处理窗口，查询闯红灯的具体违章记录，包括违章时间、地点及照片等，确保信息无误。
- 携带驾驶证、车辆行驶证和身份证，前往当地交警大队违法处理窗口或通过线上渠道处理违章记录，并按规定缴纳罚款。逾期未缴将产生滞纳金。
驾驶证扣留：
- 根据我国相关法律规定，闯两次红灯达到12分，公安机关交通管理部门将扣留您的驾驶证。
参加满分学习与考试：
- 在缴纳罚款后的15日内，您需到机动车驾驶证核发地或违法行为地的公安机关交通管理部门报名参加为期七日的道路交通安全法律、法规和相关知识学习。每日学习时间通常不少于一定学时（具体以当地规定为准）。
- 学习结束后，车辆管理所将在20日内安排道路交通安全法律、法规和相关知识考试（即科目一考试）。您需提前预约考试时间，并按时参加考试。
- 考试合格后，记分将被清除，并发还机动车驾驶证。若考试不合格，需重新预约并参加考试，直至合格为止。
特定情况下的驾驶技能考试：
- 若您在一个记分周期内记分2次以上达到12分，除上述处理外，还需接受驾驶技能考试。
- 驾驶技能考试按照您机动车驾驶证载明的最高准驾车型进行。
- 考试合格的，记分予以清除，发还机动车驾驶证；考试不合格的，继续参加学习和考试。
特殊驾照（A、B类）的降级处理：
- 如果您持有大型客车、牵引车、城市公交车、中型客车、大型货车驾驶证（即A、B类驾照），在一个记分周期内有记满12分记录的，车辆管理所将注销其最高准驾车型驾驶资格，并通知您在三十日内办理降级换证业务。
二、法律依据
- 根据《机动车驾驶证申领和使用规定》第七十一条，公安机关交通管理部门对机动车驾驶人的道路交通安全违法行为，除依法给予行政处罚外，实行道路交通安全违法行为累积记分制度。记分周期为12个月，满分为12分。机动车驾驶人在一个记分周期内记分达到12分的，应当按规定参加学习、考试。
- 根据《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》的相关规定，机动车驾驶人在一个记分周期内记分未达到12分，所处罚款已经缴纳的，记分予以清除；记分虽未达到12分，但尚有罚款未缴纳的，记分转入下一记分周期。同时，机动车驾驶人在机动车驾驶证丢失、损毁、超过有效期或者被依法扣留、暂扣期间以及记分达到12分的，不得驾驶机动车。
三、注意事项
- 不可继续驾车：两次闯红灯扣12分后，您不得继续驾驶机动车，否则将面临法律处罚。
- 及时处理违章：建议您尽快查询并处理违章记录，以避免因拖延而导致更多不必要的麻烦。
- 不可代扣分数：严禁使用他人驾驶证代扣分数，此行为属于“买卖分”，是违法的，将受到严厉处罚。
- 增强交通安全意识：作为驾驶人，您应严格遵守交通规则，避免再次发生违法行为，确保行车安全。
综上所述，闯两次红灯扣12分后，您需严格按照相关法律规定参加学习和考试，以恢复驾驶资格。同时，也提醒您要严格遵守交通规则，确保行车安全。