当企业的营业内容与实际经营范围不符时，主要由市场监督管理部门进行处罚，具体处罚措施依据违规情节的严重程度而定。以下是对此问题的详细分析：

1. 警告与责令改正

   • 对于情节轻微的情况，市场监督管理部门通常会首先给予警告，并责令企业限期改正其违规行为。这是为了促使企业回归合法合规的经营轨道，避免进一步的法律风险。

2. 没收违法所得与罚款

   • 如果企业在超出核准登记的经营范围后有违法所得，相关部门将没收这些违法所得，并可能并处违法所得1倍以上3倍以下的罚款，但罚款上限为3万元。
   • 若企业没有违法所得，则可能面临1万元以下的罚款。
   • 特别地，对于需要取得行政许可方可经营的项目（前置许可经营项目），若未取得相应许可擅自从事经营活动，处罚将更加严厉。例如，未经许可从事食品生产经营，将依据相关法律没收违法所得、违法经营的物品及工具，并根据货值金额处以高额罚款。

3. 公司登记事项变更未办理登记

   • 如公司登记事项发生变更但未依法办理变更登记，公司登记机关将责令限期登记；逾期不登记的，将处以1万元以上10万元以下的罚款。这一规定旨在确保企业信息的准确性和透明度，维护市场秩序。

4. 吊销营业执照

   • 对于情节特别严重或屡教不改的企业，市场监督管理部门有权吊销其营业执照。这意味着企业将失去合法经营资格，无法继续从事商业活动。

5. 刑事责任

   • 如果企业擅自从事相关经营活动且情节严重，还可能构成非法经营罪等犯罪，被追究相应的刑事责任。这通常涉及严重的违法行为，如未经许可经营专营、专卖物品或其他限制买卖的物品等。

地区差异与法规遵循：

• 不同地区在具体执行上可能存在一定差异，具体应以当地法律法规和执法实践为准。因此，企业在面对此类问题时，应密切关注当地的市场监管动态和法规变化。

建议与总结：

• 为避免不必要的法律风险，企业应高度重视营业执照与实际经营范围的一致性。确保经营活动在核准的范围内进行，并及时办理相关变更登记手续。
• 如果企业发现营业执照与实际经营范围不符，应立即采取措施进行整改，并向市场监督管理部门报告相关情况。
• 如需更多相关信息或法律咨询，可以直接向我提问。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供有针对性的法律建议和帮助。