公司整体搬迁是否有赔偿以及是否合法，这主要取决于搬迁的原因、劳动合同的具体条款以及相关法律法规的规定。以下是对这一问题的详细分析：
一、政府征收导致的公司搬迁
合法性：若公司搬迁是因政府征收土地或房屋等公共利益需要，这种搬迁是合法的。政府会依据《国有土地上房屋征收与补偿条例》等相关法律法规，对被征收房屋的所有权人给予公平补偿。
赔偿内容：
- 房屋价值补偿：按照市场评估价对企业土地、建筑物等进行补偿。
- 搬迁安置补偿：涵盖设备搬迁费、安装费及停产停业损失补偿。
- 搬迁奖励：政府可能设置奖励以鼓励企业积极配合搬迁。
二、公司自行搬迁中的员工权益
合法性：公司出于自身经营需要而进行的搬迁，在符合法律法规和劳动合同约定的前提下，也是合法的。但搬迁可能对员工的工作和生活产生影响，因此需关注员工的权益保护。
赔偿情形：
- 同城内搬迁：
- 一般情况：同城内的搬迁通常不会被认为对劳动合同的履行造成实质性障碍，员工通常无权要求经济补偿。
- 特殊情况：若搬迁导致员工通勤成本大幅增加或生活受到重大影响，且公司未提供合理补救措施（如交通补贴、通勤便利等），员工有权与公司协商，协商不成解除劳动合同后可能获得经济补偿。
- 跨地区搬迁：
- 协商一致：公司应与员工协商变更劳动合同的工作地点条款。若员工同意并继续履行合同，则双方关系不变。
- 协商不一致：若员工不同意搬迁，且双方无法就工作地点变更达成一致，导致合同无法继续履行，公司应提前三十日以书面形式通知员工或额外支付一个月工资后解除劳动合同，并按规定支付经济补偿。补偿标准按员工在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资。这里的月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
三、特殊情形下的搬迁
不可抗力因素：若公司搬迁是因政府政策或城市规划等不可抗力因素导致，且劳动合同中有相关约定或搬迁对员工无实质性影响，公司可能无需支付经济补偿金。
经营需要导致的搬迁：若公司出于自身经营需要而搬迁，且搬迁导致员工工作地点发生重大变化或对生活产生较大影响，甚至无法继续履行合同，公司可能需要支付经济补偿金。补偿金数额根据员工工龄、工资水平及搬迁影响程度等因素确定。
四、法律建议
公司角度：
- 在搬迁前，应充分与员工沟通，了解员工意愿，尽量通过协商达成一致。
- 依法支付必要的经济补偿，确保搬迁过程的合法性和顺利进行。
- 参考当地政策，确保搬迁行为符合地方性法规和政策要求。
员工角度：
- 了解自己的合法权益，包括劳动合同中的工作地点条款、经济补偿标准等。
- 在遇到搬迁问题时，首先与公司进行协商，寻求合理解决方案。
- 若协商无果，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
总结来说，公司整体搬迁是否有赔偿以及是否合法，需根据具体情况进行判断。公司应依法行事，尊重员工权益；员工也应了解自己的合法权益，并在必要时采取法律手段维护自己的利益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。