黄牌工程车在非允许时段（如两点等）上高速，可能面临罚款、扣分等处罚，具体处罚措施需根据地方性法规及实际违规情形确定。以下从不同角度详细分析：

1. 地方性法规差异
   不同地区对工程车上高速的限制规定可能存在差异。例如，部分城市为缓解交通压力或保障道路安全，会明确规定黄牌工程车在特定时段（如早晚高峰、夜间部分时段）禁止驶入高速公路。若两点属于当地规定的禁止通行时段，则车辆违规上高速将面临处罚。
   建议：需查阅车辆行驶地或目的地所在省份的《高速公路管理办法》或《道路交通安全条例》，确认具体限制时段及路段。

2. 违规情形认定

   • 未办理通行证：若工程车需跨区域运输或载运不可解体物品，通常需提前向交通管理部门申请《超限运输车辆通行证》。未办理通行证擅自上高速的，可能被认定为“未按规定路线行驶”或“违规通行”，面临罚款（如200-2000元）及扣分（如记6分）。
     
   • 超限超载：若车辆存在超限（如长度、宽度、高度超过规定）或超载（总质量超过核定载质量）情形，即使持有通行证，也可能因“超限运输”或“超载运输”被处罚，罚款金额可能更高（如500-3000元），并扣分（如记6-12分）。
     
   • 违反禁令标志：若高速公路入口或路段设有“黄牌工程车禁止通行”标志，车辆违反标志指示驶入的，可能被认定为“违反禁令标志指示”，面临罚款（如200元）及扣分（如记3分）。

3. 处罚依据

   • 《道路交通安全法》：第48条规定“机动车载物应当符合核定的载质量，严禁超载；载物的长、宽、高不得违反装载要求”。第90条规定“机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者20元以上200元以下罚款”。
     
   • 《公路安全保护条例》：第33条规定“超过公路、公路桥梁、公路隧道限载、限高、限宽、限长标准的车辆，不得在公路、公路桥梁或者公路隧道行驶”。第64条规定“违反本条例的规定，在公路上行驶的车辆，车货总体的外廓尺寸、轴荷或者总质量超过公路、公路桥梁、公路隧道、汽车渡船限定标准的，由公路管理机构责令改正，可以处3万元以下的罚款”。
     
   • 地方性法规：如《XX省高速公路条例》可能明确规定“黄牌工程车在每日7:00-9:00、17:00-19:00禁止驶入高速公路”，违反者按“违反禁令标志”处罚。

4. 实际处理流程
   若被交警或路政部门查处，通常会：

   • 现场开具《违法行为处理通知书》，要求驾驶员在15日内到指定地点接受处理；
     
   • 核实车辆信息、行驶路线、是否办理通行证等；
     
   • 根据违规情形，依据上述法律条款作出处罚决定（罚款、扣分）；
     
   • 若车辆存在超限超载，可能要求卸载超限部分或转运货物后方可放行。

温馨提示：黄牌工程车因车身较大、载重较高，对道路安全影响较大，各地对其通行限制通常较严格。建议出行前：

1. 确认车辆是否符合载重、尺寸等标准；
   
2. 提前向交通管理部门申请通行证（如需）；
   
3. 规划合法路线，避开禁止通行时段及路段。
   

如有进一步疑问或需具体案例分析，可直接向我咨询。