您好，关于您提出的“办房产证填的书面协议是否有效”的问题，这主要取决于协议的具体内容、签订过程以及是否符合相关法律法规的规定。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们要明确的是，书面协议在符合法律规定的条件下是有效的。书面形式作为合同的一种常见形式，其优势在于能够有形地表现所载内容，并可以随时调取查用，这为合同的履行和纠纷的解决提供了有力的证据支持。在房产交易中，办理房产证时填写的书面协议，通常涉及房屋买卖、产权转移等重要事项，这些协议一旦签订，就具有法律约束力。
接下来，我们分析书面协议有效的几个关键要素：
真实意愿：协议双方必须是在真实意愿的基础上签订协议，不存在欺诈、胁迫等情形。这是协议有效的前提条件。
明确当事人：协议中必须能够明确识别出签订协议的双方当事人，即房屋买卖的双方。这是确定协议权利义务关系的基础。
确定权利义务：协议中必须明确双方的权利义务关系，包括房屋的价格、付款方式、过户时间、违约责任等。这些条款是协议的核心内容，也是判断协议是否有效的关键。
不违反法律法规和公序良俗：协议的内容必须符合法律法规的规定，不得违反公序良俗。否则，协议将被视为无效。
无禁止性约定：在之前签订的书面合同中，如果没有约定禁止通过其他方式对合同进行变更或补充，那么通过微信等电子方式重新达成的协议，可以视为对原合同的变更或补充，同样具有法律效力。
以您提到的房产交易为例，如果在办理房产证过程中，双方通过书面协议对房屋买卖的某些条款进行了变更或补充，且该协议符合上述有效要素，那么该协议就是有效的。即使双方之前已经签订了书面合同，但新的书面协议仍然可以对原合同进行变更或补充，只要双方达成一致意见并签字确认。
此外，我还想提醒您，在签订任何协议时，都要仔细阅读协议条款，确保自己的权益得到充分保障。如果可能的话，可以请专业律师对协议进行审查，以确保协议的合法性和有效性。
综上所述，办房产证填的书面协议在符合法律规定的条件下是有效的。希望我的解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。