当公司决议被确认无效或撤销后，已经按决议履行的股东，其处理方式需根据具体情况来定，但总体原则是恢复原状或进行合理补偿。以下从不同角度为您详细分析：

一、决议无效或撤销的法律后果

首先，我们需要明确公司决议被确认无效或撤销的法律后果。根据《公司法》及相关司法解释，无效的决议自始没有法律约束力，而可撤销的决议在被撤销前是有效的，但撤销后其效力溯及至决议作出之时。这意味着，无论是无效还是被撤销的决议，其产生的法律效果都将被否定。

二、已履行决议的股东的处理方式

1. 恢复原状：

   • 情况说明：如果决议的无效或撤销导致公司状态或股东权益发生了变化，且这种变化是可以逆转的，那么股东有权要求公司恢复原状。例如，决议涉及公司资产的转让，且该转让尚未完成或可以撤销，那么股东可以要求撤销转让，恢复公司资产的原状。
   • 法律依据：根据《民法典》中关于民事法律行为无效或被撤销后的法律后果的规定，行为人因该行为取得的财产，应当予以返还；不能返还或者没有必要返还的，应当折价补偿。

2. 合理补偿：

   • 情况说明：如果决议的无效或撤销导致公司或股东遭受了损失，且这种损失无法通过恢复原状来弥补，那么受损方有权要求责任方进行合理补偿。例如，决议涉及公司对外投资，且该投资已经产生损失，那么股东可以要求公司或其他责任方根据过错程度进行补偿。
   • 法律依据：同样依据《民法典》的相关规定，有过错的一方应当赔偿对方由此所受到的损失；各方都有过错的，应当各自承担相应的责任。

3. 内部责任分担：

   • 情况说明：在决议无效或被撤销的情况下，如果涉及多个股东或董事的责任分担问题，那么需要根据各自的过错程度来确定责任比例。例如，如果决议的通过是由于某些股东或董事的故意或重大过失导致的，那么他们应当承担更大的责任。
   • 操作建议：在这种情况下，建议公司内部先进行协商，确定各自的责任比例和补偿方式。如果协商不成，可以寻求法律途径解决，如提起诉讼或仲裁。

三、实际操作中的注意事项

1. 及时采取行动：一旦发现决议可能无效或被撤销，股东应尽快采取行动，以免错过恢复原状或寻求补偿的最佳时机。
2. 保留证据：股东应保留与决议相关的所有证据，包括决议文本、会议记录、投票情况等，以便在需要时证明自己的权益。
3. 寻求专业帮助：由于公司决议无效或撤销的问题往往涉及复杂的法律关系和利益纠葛，因此建议股东在处理此类问题时寻求专业律师的帮助。

总结来说，当公司决议被确认无效或撤销后，已经按决议履行的股东应根据具体情况要求恢复原状或进行合理补偿。在处理此类问题时，股东应保留证据、及时采取行动，并寻求专业律师的帮助以确保自己的权益得到妥善保护。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。