申请行政复议以后取消申请，一般情况下仍可以进行行政诉讼，但需注意特殊情形下的限制。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情形
在大多数情况下，如果法律、法规没有特殊规定，当事人在撤回行政复议申请后，只要在法定的行政诉讼起诉期限内（通常为自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内，特殊情况下法律另有规定），仍然有权向人民法院提起行政诉讼。例如，对某行政处罚决定不服的当事人，在复议过程中撤回了申请，只要未超过起诉期限，即可向法院提起诉讼以寻求救济。
二、特殊情形
复议前置的情况：
- 特定行政争议必须先经过行政复议，对复议决定不服才能提起行政诉讼（即复议前置）。在这种情况下，如果当事人撤回了行政复议申请，则未经复议程序，不得直接向人民法院提起行政诉讼。例如，《行政复议法》及相关法律规定了涉及自然资源所有权或使用权的争议、税收争议等需要先复议再诉讼的情形。因此，对于这类案件，撤回复议申请后必须重新进行复议，对复议结果不服时方可提起诉讼。
因自身原因放弃复议且被记录在案：
- 如果申请人出于自身故意或重大过失等原因撤回行政复议申请，如为了拖延时间、干扰行政机关正常执法等不当目的，法院可能会认为其已放弃了通过复议和诉讼寻求救济的权利，从而不再受理其后续的行政诉讼。这种情况虽然相对较少，但各地法院的认定标准可能存在差异，需具体案件具体分析。
复议机关的不作为或逾期不作复议决定：
- 如果当事人是因为复议机关的不作为或逾期不作复议决定而撤回申请，那么可以直接向法院提起行政诉讼，无需再次经历复议程序。
明确放弃诉讼权利或接受复议处理结果：
- 在撤回复议申请时，如果当事人明确表示放弃诉讼权利，或者复议机关已经对其复议请求进行了实质性处理且当事人接受了该处理结果，那么通常就不能再提起行政诉讼。这是因为当事人已经通过自己的行为表示了对复议结果的认可，从而丧失了后续诉讼的权利。
三、法律建议
仔细考虑权利与义务：
- 当事人在撤回行政复议申请前，应仔细考虑自己的权利和义务，以及撤回复议申请可能带来的法律后果。如果撤回复议申请后仍想寻求法律救济，应确保在法定的起诉期限内提起行政诉讼。
咨询专业法律人士：
- 由于法律问题的复杂性和多样性，当事人在做决定前应咨询专业的法律人士，如律师或法律顾问，以确保决策的正确性。他们可以根据具体情况提供针对性的法律建议和指导。
保留相关证据和材料：
- 当事人在撤回复议申请或提起行政诉讼时，应保留好相关证据和材料，如原行政行为的相关文件、复议申请书及撤回申请的相关证明等。这些证据和材料在后续的法律程序中可能起到关键作用。
综上所述，申请行政复议以后取消申请，一般情况下仍可以进行行政诉讼，但需注意特殊情形下的限制。当事人在做决定前应仔细考虑自己的权利和义务，并咨询专业的法律人士以确保决策的正确性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。