有限责任公司由自然人投资或控股的，通常属于私营企业，但并非绝对，具体需结合企业实际情况判断。以下从多个角度进行详细分析：
一、通常属于私营企业的情况
根据私营企业的定义，它是指由自然人投资设立或由自然人控股，并以雇佣劳动为基础的营利性经济组织。在有限责任公司中，如果企业的资本主要来源于自然人，且这些自然人通过股东会或董事会等决策机构对公司的经营管理等重大事项进行决策，掌握企业的经营决策和控制权，那么该企业一般会被认定为私营企业。
举例：两个自然人共同出资成立一家有限责任公司，其中一人持股60%，另一人持股40%。他们通过股东会对公司的经营管理等重大事项进行决策，这种情况下，企业符合私营企业的典型特征，即资产属于私人所有，以雇佣劳动为基础进行盈利活动。
二、特殊情况下的判断
虽然自然人投资或控股的有限责任公司大多属于私营企业，但在某些特殊情况下，企业的性质可能会因国有资本或集体资本的参与而发生变化。
国有相对控股：在混合所有制企业中，即使大部分股东是自然人，但如果国有资本在企业中具有相对控股地位，能够对企业的经营决策起到决定性作用，那么该企业就不再属于私营企业，而是具有国有性质。例如，某混合所有制企业中，自然人股东持股60%，但国有股东持股40%且拥有关键决策权，此时企业可能被视为具有国有性质。
集体资本主导：同样地，如果企业中有集体资本投入，并且集体资本在企业运营和决策中占据主导地位，即使存在自然人投资或控股，该企业也可能被认定为集体企业，而非私营企业。例如，某企业中，自然人股东持股51%，但集体资本通过协议或其他方式实际控制了企业的运营和决策，此时企业可能被视为集体企业。
三、法律背景与建议
从法律角度来看，企业的性质不仅关系到其税收、融资等政策待遇，还涉及到企业治理结构、股东权利与义务等方面。因此，在判断企业性质时，需要综合考虑企业的组织形式、经营情况以及国有资本或集体资本的参与度等因素。
建议：如果您对某家有限责任公司的性质存在疑问，或者需要了解该企业在法律上的具体定位和政策待遇，建议您查阅该企业的章程、股东名册、出资协议等文件，并咨询专业律师进行详细分析。同时，您也可以直接向我提问，我会根据您的具体情况提供针对性的法律建议。