作为占股20%的公司合伙人，在公司经营主体“跑了”且存在债务纠纷的情况下，是否会影响到个人，这主要取决于公司的性质以及债务的具体情况。以下从不同角度为您详细分析：
一、公司性质的影响
有限责任公司：
- 一般情况：在有限责任公司中，股东以其认缴的出资额为限对公司承担责任。这意味着，如果公司经营主体“跑了”，且公司债务未超出股东认缴的出资额，那么您作为股东，通常只需要承担您认缴的那部分出资责任，不会影响到您的个人财产（除非存在特殊情况，如股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任逃避债务等）。
- 特殊情况：如果股东存在滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的，应当对公司债务承担连带责任。这包括但不限于股东与公司资金混同、业务混同、人员混同等情况。
合伙企业：
- 普通合伙：在普通合伙企业中，合伙人对合伙企业债务承担无限连带责任。这意味着，如果公司（实际为合伙企业）经营主体“跑了”，且存在债务纠纷，您作为合伙人，可能需要用个人财产来清偿合伙企业的债务。
- 有限合伙：在有限合伙企业中，有限合伙人以其认缴的出资额为限对合伙企业债务承担责任，而普通合伙人则承担无限连带责任。如果您是有限合伙人，且已足额出资，那么您的责任通常限于您的出资额；但如果您是普通合伙人，则可能需要承担无限连带责任。
二、债务具体情况的影响
- 债务是否合法：如果公司债务是合法债务，且您作为股东或合伙人未存在上述特殊情况，那么您通常只需要按照公司性质承担相应责任。但如果债务是非法的，如因欺诈、非法集资等产生的债务，那么您可能需要承担更复杂的法律责任，甚至可能涉及刑事责任。
- 债务是否已到期：如果债务已到期且公司未偿还，债权人可能会采取法律手段追讨债务。这可能导致公司资产被查封、拍卖等，进而影响到您的权益（如您作为股东的分红权等）。但如果您已按照公司性质承担了相应责任，且个人财产未与公司财产混同，那么您的个人财产通常不会受到影响。
三、建议与措施
- 核实公司性质：首先，您需要核实公司的性质是有限责任公司还是合伙企业，以及您在公司中的具体角色（是股东还是合伙人，以及是普通合伙人还是有限合伙人）。
- 审查债务情况：了解公司债务的具体情况，包括债务金额、债务性质、债务是否已到期等。这有助于您评估自己可能承担的法律责任。
- 咨询专业律师：鉴于法律问题的复杂性，我建议您咨询专业律师，以便更准确地评估您的法律责任，并采取相应的法律措施来保护自己的权益。
- 采取预防措施：为了避免类似情况再次发生，您可以考虑在公司章程或合伙协议中明确约定股东或合伙人的责任限制、债务处理机制等条款。
总之，作为占股20%的公司合伙人，在公司经营主体“跑了”且存在债务纠纷的情况下，您是否会受到影响取决于公司的性质以及债务的具体情况。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。