针对您提出的“员工二次入职有没有试用期”的问题，这是一个涉及劳动法规定及实际应用的重要咨询。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》第十九条的规定，同一用人单位与同一劳动者只能约定一次试用期。这一条款从根本上限制了用人单位重复约定试用期的行为，旨在保护劳动者的权益，避免用人单位通过反复设定试用期来规避对劳动者的长期雇佣责任。

接下来，我们分析您提到的具体情况：员工从本公司A岗位离职5年后，再次入职本公司B岗位，且两个岗位的职责和层级完全不同。尽管岗位发生了变化，但根据《劳动合同法》的明确规定，同一用人单位与同一劳动者之间的试用期约定仍然受到严格限制，即只能约定一次。

您还提到了两份劳动部文件中的相关内容，即《劳动部关于实行劳动合同制度若干问题的通知》和《关于〈劳动法〉若干条文的说明》。这两份文件在特定历史时期对劳动法的实施提供了具体指导，但其中关于“针对不同岗位可重新约定试用期”的表述，与《劳动合同法》的规定存在不一致。在这种情况下，我们应当严格按照《劳动合同法》的规定执行，因为《劳动合同法》作为上位法，具有更高的法律效力。

此外，您还提到了各地法院对此类情况的判决书结果不完全一致。这可能是由于不同地区的法院在具体案件审理中，对法律条文的理解和应用存在细微差异。但无论如何，《劳动合同法》第十九条的规定是明确且统一的，即同一用人单位与同一劳动者只能约定一次试用期。

综上所述，对于员工二次入职的情况，无论其是否从事原工作岗位或他种岗位，用人单位均不得再设试用期。这是基于《劳动合同法》的明确规定，旨在保护劳动者的合法权益，促进劳动关系的和谐稳定。希望这一解答能够对您有所帮助。如有其他疑问或需要进一步的法律咨询，请随时告知。