破产管理人不能在破产公司占股份。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

一、法律规定的角度

根据《中华人民共和国企业破产法》及相关司法解释的规定，破产管理人是由人民法院指定，负责接管破产企业财产、管理破产事务、代表破产企业参与诉讼等职责的专门机构或人员。其职责的核心在于公正、中立地处理破产事务，保护债权人和债务人的合法权益。因此，法律明确禁止破产管理人持有破产企业的股份，以避免利益冲突和损害公正性。

二、利益冲突的角度

如果破产管理人持有破产企业的股份，那么其在处理破产事务时可能会面临利益冲突。例如，在决定是否出售破产企业的资产、如何分配破产财产等关键问题上，破产管理人可能会因为持有股份而偏向于保护自己的利益，从而损害其他债权人的利益。这种利益冲突不仅违反了法律的规定，也违背了破产管理人的职业道德和公正原则。

三、实际操作的角度

在实际操作中，如果破产管理人被发现持有破产企业的股份，人民法院有权撤销其管理人资格，并可能对其处以罚款等法律制裁。同时，这种行为还可能引发其他债权人的质疑和诉讼，导致破产程序陷入混乱和延误。因此，从实际操作的角度来看，破产管理人持有破产企业股份也是不可行的。

四、特殊情况的处理

虽然一般情况下破产管理人不能在破产公司占股份，但在某些特殊情况下，如破产管理人原本就是破产企业的股东或关联方，且这种关系在破产程序开始前已经存在并公开披露，且人民法院认为这种关系不会影响破产管理人的公正性和独立性时，可能会允许其继续担任破产管理人。然而，这种情况非常罕见，且需要严格的审查和监管。

总结与建议：

破产管理人不能在破产公司占股份，这是由法律规定、利益冲突和实际操作等多方面因素共同决定的。如果您在处理破产事务时遇到相关问题或疑虑，建议直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和帮助。