第三方提供的航行出行信息电子数据，在符合一定条件下，是可以作为刑事案件控诉证据的。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、电子数据作为证据的合法性
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十条的规定，可以用于证明案件事实的材料，都是证据。证据包括物证、书证、证人证言、被害人陈述、犯罪嫌疑人、被告人供述和辩解、鉴定意见、勘验、检查、辨认、侦查实验等笔录、视听资料、电子数据等。因此，电子数据作为证据的一种形式，在刑事案件中是可以被采纳的。
二、第三方提供的航行出行信息电子数据的证据效力
真实性：第三方提供的航行出行信息电子数据，如果能够证明其来源真实、可靠，且未被篡改或伪造，那么该数据就具有真实性，可以作为证据使用。例如，如果第三方是正规的航运公司或相关服务提供商，其提供的航行记录、乘客信息等电子数据，在正常情况下应该是真实可靠的。
关联性：电子数据必须与案件事实具有关联性，才能作为证据使用。在交通运输领域的刑事案件中，如果第三方提供的航行出行信息电子数据能够直接或间接证明犯罪嫌疑人的犯罪行为、犯罪时间、犯罪地点等关键事实，那么该数据就具有关联性。
合法性：电子数据的收集、提取、保存和移送等程序必须符合法律规定，才能作为证据使用。如果第三方提供的航行出行信息电子数据是通过非法手段获取的，或者违反了相关法律规定，那么该数据就可能被排除在证据之外。
三、实际应用中的注意事项
证据的收集与保存：在收集第三方提供的航行出行信息电子数据时，必须确保数据的完整性和原始性，避免数据被篡改或损坏。同时，要妥善保存相关证据，以便在需要时能够提供完整的证据链。
证据的审查与判断：在刑事案件中，法院会对所有证据进行审查与判断，以确定其真实性、关联性和合法性。因此，在使用第三方提供的航行出行信息电子数据作为证据时，必须接受法院的审查与判断。
与其他证据的印证：为了增强电子数据的证明力，可以将其与其他证据进行印证。例如，可以将第三方提供的航行出行信息电子数据与犯罪嫌疑人的供述、证人证言、监控录像等证据进行比对和印证，以形成完整的证据链。
四、案例分析
在实际案例中，第三方提供的航行出行信息电子数据经常被用作刑事案件的证据。例如，在一起涉及海上走私的案件中，检察机关就利用了航运公司提供的航行记录、货物清单等电子数据作为证据，成功指控了犯罪嫌疑人的走私行为。这些电子数据不仅证明了犯罪嫌疑人的犯罪行为，还提供了关键的犯罪时间和地点等信息，为案件的侦破和审判提供了有力支持。
综上所述，第三方提供的航行出行信息电子数据在符合真实性、关联性和合法性的条件下，是可以作为刑事案件控诉证据的。在实际应用中，需要注意证据的收集与保存、审查与判断以及与其他证据的印证等问题。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。