预付款比例是可以在合同偏离表中进行约定的。以下从多个角度对此问题进行详细分析：
一、合同偏离表的作用与性质
合同偏离表，通常是在主合同之外，对主合同中的某些条款进行补充、修改或特别约定的文件。它作为主合同的附件，与主合同具有同等的法律效力。因此，在合同偏离表中约定预付款比例，是对主合同中相关条款的一种合法、有效的补充或修改。
二、预付款比例约定的合法性
合同自由原则：根据合同法的相关规定，合同双方当事人在平等、自愿的基础上，有权自由约定合同的内容，包括预付款的比例。只要这种约定不违反法律、行政法规的强制性规定，不损害国家、集体或第三人的利益，就是合法有效的。
预付款的性质：预付款是合同一方为了表明履行合同的诚意，在合同签订后、履行前，按照合同约定向对方支付的一定数额的金钱。它不属于定金，也不具有担保性质，而是合同履行的一种预先安排。因此，在合同偏离表中约定预付款比例，并不违反预付款的法律性质。
三、在合同偏离表中约定预付款比例的注意事项
明确约定：在合同偏离表中，应当明确、具体地约定预付款的比例、支付时间、支付方式等关键条款，以避免后续产生争议。
与主合同一致：虽然合同偏离表是对主合同的补充或修改，但其中的约定应当与主合同的整体精神和目的相一致，不得与主合同中的其他条款产生冲突或矛盾。
遵守法律法规：在约定预付款比例时，应当遵守相关法律法规的规定，如不得约定过高的预付款比例以损害对方的利益，或者利用预付款进行非法活动等。
四、可能产生的法律后果
如果合同双方在合同偏离表中合法、有效地约定了预付款比例，并按照约定履行了各自的义务，那么这种约定将受到法律的保护。如果一方违反约定，未按照约定的比例支付预付款，或者擅自改变预付款比例，那么另一方有权要求其承担违约责任，包括但不限于要求支付违约金、赔偿损失等。
综上所述，预付款比例是可以在合同偏离表中进行约定的。但需要注意的是，在约定时应当明确、具体，并遵守相关法律法规的规定，以确保约定的合法性和有效性。如果您在合同签订或履行过程中遇到任何法律问题，可以直接向我咨询。