在限速40公里/小时的国道上开到46公里/小时，这确实是一种超速行为。关于这种行为的处罚，需要结合多个因素来综合考虑，以下是我为您提供的详细解答：
一、超速比例与法律规定
首先，我们来计算一下超速比例。在限速40公里/小时的情况下，开到46公里/小时，超速比例为（46 - 40）÷ 40 × 100% = 15%。根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶非特定车辆（如校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆）在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶，超过规定时速未达到百分之二十的，是不记分的。但这一规定并不意味着超速行为不会受到其他形式的处罚。
二、可能的处罚措施
罚款：依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。因此，即使超速未达20%，您仍可能面临罚款处罚。
警告：在部分地区，对于轻微超速行为，交通管理部门可能会选择给予警告而非罚款，以起到教育和警示的作用。
地方“容忍值”政策：为了规范交通执法，许多地方设置了超速的“容忍值”。在这个范围内，一般只会给予警告，不进行罚款和记分。但具体“容忍值”的设定因地区而异，有的地方可能规定超速10% - 20%属于轻微交通违法行为，仅予以警告；而有的地方则可能设置更高的“容忍值”。
三、不同车辆和道路类型的特殊情况
特定车辆：如果您驾驶的是校车、中型以上载客载货汽车、危险物品运输车辆等特定车辆，在高速公路、城市快速路以外的道路上行驶超过规定时速百分之十以上未达到百分之二十的，一次记1分，并可能面临罚款处罚。
高速公路或城市快速路：对于非特定车辆在高速公路或城市快速路上的超速行为，虽然目前全国没有统一的记分规定，但部分地方可能会出台相关细则进行管理。因此，存在被当地交通管理部门记分、罚款的可能性。
四、建议与总结
为了自身和他人的安全，我建议您严格遵守道路交通安全法律法规，按照规定时速行驶，避免超速。超速行驶不仅可能面临处罚，更重要的是会增加交通事故的风险，危及自身和他人的安全。如果您对当地的交通管理规定有疑问或需要更详细的法律意见，可以咨询专业律师或法律机构来获取帮助。
综上所述，限速40公里/小时开到46公里/小时属于超速行为，但具体是否会受到处罚以及处罚的种类和程度需结合当地交通管理部门的执法标准和实际情况来判断。为了确保行车安全和避免法律纠纷，请始终遵守交通规则，保持合理的车速。