物业通常无权扣除业主的初始登记证书。以下从不同角度对此问题进行分析：

一、物业的权力范围

物业公司的职责主要是依据物业服务合同，为业主提供物业管理服务，包括但不限于房屋及配套设施的维护、环境卫生管理、公共秩序维护等。物业公司的权力来源于物业服务合同以及相关法律法规的授权，但这些授权并不包括扣除业主的初始登记证书。初始登记证书是业主房屋产权的重要证明文件，其所有权和使用权均属于业主，物业公司无权擅自扣留或处置。

二、物业扣除初始登记证书的可能原因及合法性分析

1. 业主欠费问题：

   • 如果业主拖欠物业费或其他相关费用，物业公司可能会试图通过扣留初始登记证书等方式来迫使业主缴费。然而，这种做法缺乏法律依据。物业公司应当通过合法途径，如协商、诉讼等，来追讨欠费，而不是擅自扣留业主的财产证明文件。

2. 其他纠纷：

   • 如果业主与物业公司之间存在其他纠纷，如房屋维修、公共设施使用等，物业公司同样无权通过扣留初始登记证书来解决问题。双方应当通过协商、调解或诉讼等合法途径来解决纠纷。

三、业主的应对措施

1. 与物业公司协商：

   • 如果物业公司扣留了业主的初始登记证书，业主首先应当尝试与物业公司进行协商，要求物业公司立即归还证书，并明确告知物业公司其行为的违法性。

2. 向相关部门投诉：

   • 如果协商无果，业主可以向当地的房地产管理部门、消费者协会等相关部门进行投诉，寻求帮助和支持。

3. 法律途径：

   • 如果物业公司的行为给业主造成了损失，业主还可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益，如提起民事诉讼等。

四、法律后果

如果物业公司擅自扣留业主的初始登记证书，可能面临法律责任。根据相关法律法规的规定，物业公司可能因侵犯业主的财产权而承担民事赔偿责任，甚至可能面临行政处罚。

综上所述，物业通常无权扣除业主的初始登记证书。如果业主遇到此类问题，应当积极与物业公司协商、向相关部门投诉或寻求法律帮助来维护自己的合法权益。如果您在房产纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。