结论概述：结合新闻背景，北方华创在90:1深孔刻蚀设备上取得突破，若获订单，确实会涉及知识产权与商业秘密保护义务。以下从知识产权保护义务和商业秘密保护义务两个维度进行详细分析。
一、知识产权保护义务
专利权保护：
- 自主研发与专利申请：北方华创在深孔刻蚀设备上的技术突破，若属于自主研发成果，应及时申请专利，以获得法律保护。专利权保护是创新成果的重要法律保障，能够防止他人未经许可实施其专利技术。
- 专利侵权风险：在获得订单并生产销售设备的过程中，北方华创需确保不侵犯他人的专利权。这包括避免使用他人已获专利的技术方案，或在必要时获得专利权人的许可。
著作权保护：
- 技术文档与软件著作权：深孔刻蚀设备的研发过程中，会产生大量的技术文档和软件代码。这些文档和代码若具有独创性，可构成著作权法保护的作品。北方华创应妥善保管这些资料，防止被他人非法复制或传播。
商标权保护：
- 品牌标识与商标注册：北方华创在市场推广和产品销售中，会使用其品牌标识。为确保品牌权益，应提前进行商标注册，防止他人抢注或冒用。
二、商业秘密保护义务
商业秘密的定义与范围：
- 定义：商业秘密是指不为公众所知悉、能为权利人带来经济利益、具有实用性并经权利人采取保密措施的技术信息和经营信息。
- 范围：在深孔刻蚀设备的研发和生产过程中，涉及的技术诀窍、工艺流程、客户名单、供货渠道等，均可能构成商业秘密。
保密措施与义务：
- 内部保密制度：北方华创应建立完善的内部保密制度，明确保密范围、保密措施和保密责任。对涉及商业秘密的资料和文件，应采取加密、限制访问等保密措施。
- 员工保密义务：与员工签订保密协议，明确员工在任职期间及离职后一定期限内，不得泄露或使用公司的商业秘密。对于违反保密义务的员工，应依法追究其法律责任。
- 合作方保密义务：在与供应商、客户等合作方进行业务往来时，应签订保密协议，要求合作方对涉及商业秘密的信息予以保密。
商业秘密侵权风险与应对：
- 侵权风险：在市场竞争中，北方华创的商业秘密可能面临被他人非法获取、使用或披露的风险。这可能导致公司技术优势丧失，市场份额下降，甚至面临法律纠纷。
- 应对措施：一旦发现商业秘密被侵权，北方华创应及时收集证据，通过法律途径维护自身权益。这包括向侵权方发出警告函、提起民事诉讼或向行政机关投诉等。
三、热点事件延伸思考与法律建议
- 加强知识产权与商业秘密保护意识：北方华创在取得技术突破的同时，应高度重视知识产权与商业秘密的保护工作。通过加强内部管理、完善保密制度、提高员工保密意识等措施，确保公司的技术成果和商业秘密得到有效保护。
- 积极应对法律纠纷：在市场竞争中，法律纠纷难以避免。北方华创应建立完善的法律纠纷应对机制，及时咨询专业律师，制定应对策略，确保公司在法律纠纷中处于有利地位。
- 关注行业动态与法律法规变化：半导体行业技术更新换代迅速，法律法规也在不断完善。北方华创应密切关注行业动态和法律法规变化，及时调整公司的知识产权和商业秘密保护策略，以适应市场变化和法律要求。
综上所述，北方华创在深孔刻蚀设备上取得突破并获得订单后，确实会涉及知识产权与商业秘密保护义务。公司应从多个维度加强保护工作，确保自身的技术成果和商业秘密得到有效保护。如有任何法律疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。