针对您提出的问题，即“亲子鉴定不是亲生的，我和女方办理结婚证后，孩子可以上户口吗”，以下是我的详细解答：
首先，需要明确的是，新生儿上户口的基本流程通常要求提供出生医学证明、父母双方的身份证、结婚证等相关材料。这是全国范围内普遍适用的规定，旨在确保户籍登记的准确性和合法性。
针对您的情况，虽然您和女方已经办理了结婚证，但亲子鉴定结果显示孩子并非您亲生。这一情况在户籍管理上可能会带来一些特殊考虑。具体来说：
出生医学证明：如果出生医学证明上已经明确标注了孩子的父亲信息，并且该信息与您不符，那么户籍部门在审核材料时很可能会对此产生疑虑。
亲子鉴定要求：在大多数情况下，如果户籍部门对提供的材料存在疑虑，或者需要确认新生儿与父亲之间的亲子关系，他们可能会要求提供具有资质的鉴定机构出具的亲子鉴定证明。特别是在非婚生育或亲子关系存在争议的情况下，这一要求更为常见。
具体政策差异：需要注意的是，不同地区的户籍管理政策可能存在差异。有些地区可能对于非亲生子女随父落户有更为严格的要求，比如必须提供亲子鉴定证明；而有些地区则可能相对宽松，只要材料齐全且符合规定，就可以办理户口。
建议操作：鉴于您的情况特殊，我建议您在办理孩子户口前，先咨询当地户籍管理部门或相关法律机构，了解具体的政策要求和操作流程。如果确实需要提供亲子鉴定证明，那么您需要按照要求进行鉴定，并确保鉴定结果符合户籍管理的要求。
综上所述，虽然您和女方已经办理了结婚证，但孩子并非您亲生的情况下，办理户口可能会面临一些特殊要求和挑战。为了确保顺利办理户口，我建议您提前了解当地政策，并按照要求准备相关材料。如有需要，也可以寻求专业法律机构的帮助和指导。