结论前置：逾期三个月后还款，具体是本金还是利息，需根据借款合同中的约定以及相关法律法规来确定，通常情况下，会按照先利息后本金的顺序进行冲抵。
详细分析：
合同约定优先：
- 在民间借贷或金融保险合同中，双方通常会就还款顺序、利息计算方式等条款进行明确约定。如果合同中明确规定了逾期还款时先冲抵利息再冲抵本金，那么逾期三个月后还款时，自然应按照这一约定执行。
无约定或约定不明时的处理：
- 如果合同中没有明确约定还款顺序，或者约定不明，那么根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释的精神，通常会按照先利息后本金的顺序进行冲抵。这是因为利息是借款人因使用资金而应支付的费用，而本金是借款人实际借用的资金金额。在逾期还款的情况下，先支付利息再偿还本金，有助于保护债权人的合法权益。
逾期利息和违约金的计算：
- 逾期利息：通常基于逾期本金、逾期天数和约定的逾期利率来计算。公式为“逾期利息=逾期本金×逾期利率×逾期天数”。逾期利率可能会在合同中有明确约定，也可能根据法律法规的规定来确定。
- 违约金：如果合同中约定了违约金条款，那么借款人逾期还款时，除了需要支付逾期利息外，还可能需要支付违约金。违约金的数额通常会在合同中明确约定，但不得超过实际损失的30%。
逾期还款的法律后果：
- 影响个人征信：逾期还款会在个人征信记录上留下不良记录，影响借款人未来的贷款申请、信用卡申请等金融活动。
- 法律诉讼风险：如果借款人逾期还款时间较长，债权人可能会通过法律途径来追讨债务。在极端情况下，如果借款人被认定为恶意透支或诈骗等犯罪行为，还可能面临刑事责任。
建议：
- 仔细阅读合同条款：在借款前，务必仔细阅读借款合同中的各项条款，特别是关于还款顺序、利息计算方式、违约金等关键条款。
- 及时沟通协商：如果因特殊原因无法按时还款，应及时与债权人沟通协商，寻求延期还款、分期还款等解决方案。
- 避免逾期还款：尽量按时还款，以免产生不必要的逾期利息和违约金，同时保护个人征信记录。
示例说明：
假设借款人与债权人签订了一份借款合同，约定借款金额为10万元，年利率为10%，借款期限为一年。如果借款人逾期三个月还款，且合同中未明确约定还款顺序，那么根据通常的处理方式，会先计算逾期利息（假设逾期利率与合同利率相同），即“逾期利息=10万元×10%÷12×3=2500元”。如果借款人还款金额为5000元，那么其中2500元会用于支付逾期利息，剩余的2500元则用于偿还本金。
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