在建工程抵押转正式抵押登记时，若存在预查封，确实会对办理过程产生影响，但具体影响程度及能否办理需视情况而定。以下从不同角度为您详细分析：
一、预查封对抵押权设立与实现的影响
抵押权设立阶段：
- 在建工程抵押转正式抵押登记，本质上是在建工程抵押权的延续与确认。若该在建工程在抵押期间被预查封，根据《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》等相关法律，查封法院对在建工程享有优先处置权。
- 预查封的存在，可能阻碍抵押权人顺利办理正式抵押登记。因为查封措施限制了抵押人对抵押物的处分权，包括办理抵押登记等手续。若抵押人未能在查封前完成正式抵押登记，后续办理时可能需先解除查封或获得查封法院的同意。
抵押权实现阶段：
- 即便成功办理了正式抵押登记，预查封也可能对抵押权的实现造成障碍。在抵押物被拍卖、变卖时，查封法院有权优先处置抵押物，抵押权人的债权可能因此无法得到全额清偿。
- 抵押权人需密切关注查封情况，及时与查封法院沟通，确保在抵押物处置过程中能够依法行使优先受偿权。
二、不同情况下的处理建议
查封法院同意办理正式抵押登记：
- 若抵押人能够与查封法院沟通并获得同意，可继续办理正式抵押登记。此时，抵押权人应确保抵押合同合法有效，并按照不动产登记机构的要求提交相关材料，以顺利完成登记手续。
- 抵押权人应要求抵押人提供查封法院出具的同意办理抵押登记的书面文件，作为办理登记的重要依据。
查封法院不同意办理正式抵押登记：
- 若查封法院不同意办理，抵押权人需评估风险并考虑采取其他法律措施。例如，可以与抵押人协商提前清偿债务或提供其他担保物，以解除查封并办理正式抵押登记。
- 若协商无果，抵押权人可考虑通过诉讼或仲裁等法律途径维护自身权益。在诉讼或仲裁过程中，可以申请对抵押物进行保全，以防止抵押物被进一步处置导致债权受损。
三、法律风险提示与防范
风险点：
- 预查封可能导致抵押权设立受阻或实现困难，增加抵押权人的法律风险。
- 抵押人可能因查封而丧失履行债务的能力，导致抵押权人债权无法得到清偿。
防范措施：
- 抵押权人在办理在建工程抵押时，应充分了解抵押物的权属状况及是否存在查封、扣押等限制措施。
- 在抵押期间，抵押权人应定期查询抵押物的权属状况，及时发现并处理可能影响抵押权实现的问题。
- 若发现抵押物被查封，抵押权人应立即与抵押人及查封法院沟通，了解查封原因及处理进展，并制定相应的应对策略。
综上所述，在建工程抵押转正式抵押登记时若存在预查封，确实会对办理过程产生影响。抵押权人应密切关注查封情况，及时与查封法院沟通，并采取必要的法律措施防范风险。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。