核心结论：分公司出现问题时，其他项目农民工工资的支付问题需分情况处理，关键在于明确分公司与总公司的法律关系、项目资金独立性及合同履行情况。以下是具体分析：

1. 若分公司具有独立法人资格或独立核算能力
   若分公司依法登记为独立法人（如子公司形式），或虽为分公司但具备独立财务核算能力，且其他项目资金未受涉事项目影响，则其他项目的农民工工资应由该分公司自行承担支付责任。此时，农民工可依据《劳动合同法》及《保障农民工工资支付条例》，直接向该分公司主张工资，若分公司拒付，可申请劳动仲裁或向法院起诉。

2. 若分公司不具有独立法人资格且资金混同
   若分公司仅为总公司的分支机构（无独立法人资格），且资金、资产与总公司混同，或涉事项目导致分公司整体资金链断裂，则总公司需承担连带责任。根据《公司法》第14条，分公司民事责任由总公司承担，农民工可同时起诉分公司与总公司，要求支付工资。若总公司以“分公司独立经营”为由抗辩，需举证证明项目资金、财务独立，否则难以免责。

3. 若其他项目资金被挪用至涉事项目
   若分公司将其他项目的资金（包括农民工工资专用账户资金）违规挪用至涉事项目，导致其他项目工资无法支付，则涉嫌违反《保障农民工工资支付条例》第31条（工资专用账户资金不得挪用）。此时，农民工可向当地劳动监察部门投诉，要求责令分公司限期整改；若分公司拒不改正，可申请法院冻结其资产，或要求总公司垫付工资。

4. 若合同约定由总公司直接支付工资
   若农民工与总公司直接签订劳动合同，或项目合同中明确约定工资由总公司支付（如EPC总承包项目），则无论分公司是否出问题，总公司均为工资支付义务主体。农民工可直接向总公司主张权利，若总公司拒付，可依据合同约定申请仲裁或起诉。

建议行动步骤：

1. 收集证据：劳动合同、工资条、考勤记录、项目合同、分公司与总公司的关系证明（如工商登记信息）；
   
2. 优先协商：与分公司或总公司沟通，要求书面承诺支付期限；
   
3. 投诉举报：向当地劳动监察大队投诉（电话12333），或通过国务院根治欠薪平台提交线索；
   
4. 法律途径：若协商、投诉无果，可申请劳动仲裁（免费）或直接向法院起诉，要求支付工资及赔偿金。
   

若涉及复杂情况（如分公司注销、总公司拒不认账），可进一步向我咨询具体应对方案。