结论前置：民房当厂房使用引发纠纷是否可以打官司，答案是肯定的，但能否胜诉以及如何处理需分情况讨论，具体如下：

1. 若民房产权性质明确禁止商用，且未办理变更手续
   根据《民法典》第279条，业主不得违反法律、法规以及管理规约，将住宅改变为经营性用房。若民房产权证上明确标注“住宅用途”，且未通过规划、消防等部门审批变更为工业或商业用途，则擅自用作厂房的行为涉嫌违法。此时，若因噪音、污染等问题引发邻里纠纷，邻居可依据《民法典》第288条（相邻权纠纷）起诉要求停止侵害、恢复原状；若涉及行政处罚，城管、规划部门可依据《城乡规划法》第64条责令限期改正，逾期不改的可强制拆除。

2. 若民房产权性质允许商用，或已办理变更手续但存在其他纠纷
   若民房产权证标注“商住两用”或已通过合法程序变更为工业用途，但因租赁合同、安全生产、环保等问题产生纠纷，则需根据具体案由处理：

   • 租赁合同纠纷：若房东与承租人未在合同中明确约定用途，或承租人擅自改变用途导致违约，房东可依据《民法典》第716条（承租人未经同意转租或改变用途）要求解除合同并索赔；
     
   • 安全生产纠纷：若民房作为厂房存在消防、结构安全隐患，应急管理部门可依据《安全生产法》第102条责令整改，造成事故的需承担刑事责任；
     
   • 环保纠纷：若生产活动违反《环境保护法》第42条（排放污染物需审批），环保部门可责令停产整顿，并处以罚款。

3. 诉讼策略建议

   • 证据收集：需提供产权证、规划审批文件、租赁合同、现场照片、第三方检测报告（如噪音、污染数据）等证据；
     
   • 法律适用：优先以《民法典》相邻权、合同编条款为主，涉及行政处罚的需结合《城乡规划法》《安全生产法》等；
     
   • 调解优先：若纠纷涉及邻里关系或小额赔偿，可申请社区、人民调解委员会介入，降低诉讼成本。

行动建议：若您已因民房当厂房使用被起诉或计划起诉他人，建议携带产权证、合同、纠纷相关证据（如投诉记录、行政处罚决定书）等材料，进一步向我详细描述纠纷细节（如纠纷对象、具体诉求），我将为您制定诉讼方案或应诉策略。