在纪委案件中，若某人同时作为证人且自身存在违法行为，其处理方式需分情况讨论，具体如下：

1. 作为证人的法律地位与义务
   根据《中国共产党纪律检查机关案件检查工作条例》及《中华人民共和国监察法》相关规定，证人有义务如实提供与案件相关的证据材料，不得隐瞒、歪曲事实或伪造证据。若证人如实作证，其违法行为与作证行为本身无直接关联时，纪委或监察机关会将其违法行为与作证行为分开处理。

2. 证人自身违法行为的处理原则

   • 违法行为与案件无关时：证人的违法行为若与纪委调查的案件无直接关联（如证人因其他经济问题被调查），纪委可能将违法线索移交至有管辖权的机关（如公安机关、检察机关），由其依法独立处理。
     
   • 违法行为与案件有关时：若证人的违法行为与纪委调查的案件存在关联（如证人参与受贿、行贿等），其违法行为将纳入案件调查范围，可能面临双重责任：
     
     • 作证责任：若证人故意隐瞒或提供虚假证言，可能构成《刑法》第305条规定的“伪证罪”，需承担刑事责任；
       
     • 违法责任：其违法行为本身（如贪污、受贿）将依据党纪、国法追究相应责任（如开除党籍、刑事处罚）。

3. 处理流程与权利保障

   • 调查阶段：纪委或监察机关会先固定证人证言，再对其违法行为展开调查，确保程序合法；
     
   • 权利告知：证人有权知晓其作证的法律后果，并可申请回避、要求保密或委托律师协助（但需注意，在纪委调查阶段，律师介入范围受限，主要在案件移送司法机关后发挥作用）；
     
   • 合并处理：若证人违法行为构成犯罪，案件将移送检察机关审查起诉，此时证人可能同时作为犯罪嫌疑人接受审判。

总结：在纪委案件中，证人若存在违法行为，其处理需结合违法行为与案件的关联性。无论何种情况，证人均需如实作证，否则可能承担法律责任；其违法行为将由有权机关依法独立处理，确保“一事一责、不枉不纵”。若您或他人涉及此类情况，可直接向我咨询具体法律问题。